行政案件可以先立案后调查，且立案前进行初步调查取证也是合法且常见的做法，但正式的、全面的调查取证程序通常是在立案后进行。以下从法律依据、实际操作和注意事项三个角度进行详细分析：
法律依据
《中华人民共和国行政处罚法》的相关规定：
- 根据该法第五十四条，行政机关在发现可能存在应当给予行政处罚的行为时，必须全面、客观、公正地调查，收集有关证据。这表明，立案前的初步调查取证是被法律明确允许的，是行政机关作出行政处罚决定前的一个重要程序环节。该条款并未要求必须在立案后才能进行调查，而是强调了调查的全面性、客观性和公正性。
- 符合立案标准的，行政机关应当及时立案，这进一步说明了立案与调查之间的逻辑关系：即调查可以在立案前进行，以确认是否符合立案标准。
《公安机关办理行政案件程序规定》的具体条款：
- 该规定第六十条和第六十一条明确指出，公安机关在受理报案、控告、举报等后，应立即进行调查处理，以判断是否符合立案条件。这同样证实了立案前调查取证的合法性和必要性。
- 特别是第六十一条，它详细规定了公安机关对报案、控告、举报等的处理流程，包括立即调查处理、制作受案登记表和受案回执等，这些流程均发生在立案之前。
实际操作
- 在实践中，行政机关在接到报案或发现违法行为线索后，通常会进行一些初步的核实和调查工作，以判断是否符合立案条件。这种初步调查取证是为了确认是否存在需要追究行政责任的违法行为，以及该违法行为是否由本机关管辖。
- 一旦案件符合立案条件并被正式立案，行政机关将按照法定程序进行全面、客观、公正的调查取证工作，包括收集书证、物证、视听资料、电子数据、证人证言、当事人的陈述、鉴定意见、勘验笔录和现场笔录等证据。
注意事项
- 合法性：无论是立案前的初步调查取证还是立案后的正式调查取证，都必须遵守法律法规，不得侵犯他人的合法权益。
- 公正性和客观性：取证过程应公正无私，确保所收集的证据能够真实反映案件情况。取证时应保持客观态度，避免主观臆断影响证据的真实性。
- 证据的真实性、合法性和关联性：当事人在进行调查取证时，应注重证据的这“三性”，以确保其证明力。特别是证据的合法性，若取证过程中存在违法行为，将可能承担相应的法律责任。
- 证据的采纳与审查：所取得的证据是否能在诉讼中被采纳，还需经过法院的审查和认定。因此，当事人在进行调查取证时，应严格按照法律程序和规定进行，以确保证据的有效性和可信度。
综上所述，行政案件可以先立案后调查，且立案前进行初步调查取证也是合法且常见的做法。但无论何时进行调查取证，都必须遵守相关法律法规和原则，确保所取证据的真实性、合法性和关联性。如果您在行政案件方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。