结论：员工在借调期间违反借入单位的规章制度，是否可以解除劳动合同，需根据具体情况判断，主要包括借调协议的约定、规章制度的适用性以及违反制度的严重性等多个方面。
详细分析：
借调协议的约定：
- 借调协议是借出单位、借入单位和员工三方之间就借调事宜达成的协议。该协议中通常会明确借调期间员工的权利义务、管理责任归属以及违反规定的处理方式等。
- 如果借调协议中明确规定了员工在借调期间需遵守借入单位的规章制度，且违反该制度将构成解除劳动合同的条件，那么员工违反时，借出单位或借入单位有权依据协议解除劳动合同。
规章制度的适用性：
- 规章制度是用人单位为了规范员工行为、维护工作秩序而制定的内部规则。在借调关系中，规章制度的适用性可能因借调协议的具体约定而有所不同。
- 如果借调协议未明确规定规章制度适用性，但借入单位已将规章制度告知员工，且员工同意遵守，那么员工违反时，借入单位或借出单位可能依据规章制度的相关规定处理，包括解除劳动合同（需符合法律法规规定的解除条件）。
- 如果借调协议或规章制度中未明确规定员工需遵守借入单位的规章制度，或者员工未被告知且未同意遵守，那么员工违反借入单位规章制度时，可能不直接构成解除劳动合同的依据。
违反制度的严重性：
- 即使借调协议或规章制度中规定了员工需遵守借入单位的规章制度，但并非所有违反行为都足以构成解除劳动合同的理由。
- 通常，只有严重违反规章制度（如严重失职、营私舞弊、给用人单位造成重大损害等）的行为，才可能构成解除劳动合同的合法依据。
- 对于轻微违反规章制度的行为，用人单位应首先采取警告、罚款、调岗等纠正措施，而非直接解除劳动合同。
法律建议：
- 对于借出单位和借入单位而言，应在借调协议中明确约定员工在借调期间需遵守的规章制度、管理责任归属以及违反规定的处理方式等，以避免后续纠纷。
- 对于员工而言，在借调期间应认真了解并遵守借入单位的规章制度，如有疑问或异议应及时与借出单位或借入单位沟通协商。
- 若发生因违反规章制度而引发的劳动合同解除纠纷，建议双方首先通过协商、调解等方式解决；协商、调解不成的，可依法申请劳动仲裁或提起诉讼。
可能法律后果：
- 如果员工因严重违反借入单位规章制度而被解除劳动合同，且该解除行为符合法律法规和借调协议的规定，那么员工可能面临失去工作、无法获得经济补偿等法律后果。
- 如果解除行为不符合法律法规或借调协议的规定，员工则有权依法维护自己的合法权益，包括要求继续履行劳动合同、获得经济补偿或赔偿等。
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