结论：实际施工人以总包和发包承包协议约定仲裁管辖时，仲裁庭是否有管辖权需分情况讨论，主要取决于实际施工人与总包、发包方之间的法律关系以及仲裁协议的效力范围。
分析：
仲裁协议的效力范围：
- 仲裁协议是当事人之间达成的，愿意将他们之间的争议提交仲裁解决的书面协议。根据《中华人民共和国仲裁法》的相关规定，仲裁协议对当事人具有法律约束力，即只有签署仲裁协议的当事人之间才能依据仲裁协议进行仲裁。
- 如果总包和发包方在承包协议中明确约定了仲裁管辖，并且该仲裁协议符合法律规定的要件（如双方意思表示真实、仲裁事项属于可仲裁范围、仲裁协议形式合法等），那么该仲裁协议对总包和发包方之间因承包协议产生的争议具有约束力。
实际施工人的法律地位：
- 实际施工人通常指的是在建设工程中实际进行施工，但与发包方或总包方没有直接合同关系的主体。实际施工人可能因转包、违法分包等情形而介入建设工程。
- 实际施工人与总包、发包方之间的法律关系可能因具体情况而异。如果实际施工人与总包或发包方之间没有直接的仲裁协议，那么实际施工人通常不能直接依据总包和发包方之间的仲裁协议提起仲裁。
仲裁庭管辖权的确定：
- 情况一：如果实际施工人通过某种方式（如债权转让、代位权诉讼等）获得了对总包或发包方的直接请求权，并且该请求权基于的总包和发包方之间的承包协议中包含了有效的仲裁协议，那么在实际施工人明确表示接受该仲裁协议的情况下，仲裁庭可能对实际施工人与总包或发包方之间的争议具有管辖权。但这种情况较为特殊，需要具体分析。
- 情况二：如果实际施工人与总包、发包方之间没有直接的仲裁协议，且实际施工人不能通过上述特殊方式获得对总包或发包方的直接请求权，那么仲裁庭对实际施工人与总包、发包方之间的争议通常不具有管辖权。实际施工人可能需要通过诉讼等其他方式解决争议。
建议：
- 对于实际施工人而言，在介入建设工程前，应尽可能了解并明确自己与总包、发包方之间的法律关系，以及是否存在有效的仲裁协议。
- 如果实际施工人与总包、发包方之间存在争议，且争议可能涉及仲裁管辖问题，建议实际施工人及时咨询专业律师，以便准确评估自己的法律地位和可能的法律后果。
- 在实际操作中，各方应尽可能通过书面形式明确约定争议解决方式，以避免因争议解决方式不明确而产生的法律风险。
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