结论前置：用人单位以劳动者不能胜任本岗位工作为由不续签劳动合同的，一般仍需支付经济补偿金，但存在例外情形。以下从法律框架、实务操作及例外情形三个角度展开分析：

1. 法律框架：不续签劳动合同的补偿义务

根据《劳动合同法》第46条第5项，除用人单位维持或提高劳动合同条件续订劳动合同，劳动者不同意续订的情形外，劳动合同期满终止的，用人单位应当向劳动者支付经济补偿金。
关键点：

• 若用人单位主动不续签（无论劳动者是否胜任），均需支付经济补偿金；
  
• 若劳动者主动不续签，且用人单位未降低条件，则无需支付。
  

不能胜任工作本身并非法定免除补偿的事由。即使劳动者不能胜任当前岗位，用人单位若选择不续签，仍需遵循上述规则。

2. 实务操作：不能胜任工作与不续签的关联

若用人单位以“劳动者不能胜任工作”为由解除劳动合同（而非不续签），则需满足《劳动合同法》第40条第2项的程序要求：

• 证明不能胜任：需有客观证据（如考核记录、工作失误证明等）；
  
• 培训或调岗：必须先对劳动者进行培训或调整工作岗位；
  
• 再次证明不能胜任：经培训或调岗后，劳动者仍不能胜任工作的，方可解除合同。
  

但本案为不续签，非解除合同：
若用人单位未履行上述程序，直接以“不能胜任”为由不续签，属于违法终止劳动合同，需支付赔偿金（经济补偿金的2倍）。

3. 例外情形：无需支付补偿的特殊情况

仅当同时满足以下条件时，用人单位可能无需支付补偿：

• 劳动者主动提出不续签：且用人单位明确表示维持或提高原条件续订；
  
• 合同到期前已协商一致：双方书面确认不续签且无争议；
  
• 法定免责事由：如劳动者严重违反规章制度、被追究刑事责任等（但与“不能胜任”无关）。
  

提示：

• 用人单位若以“不能胜任”为由不续签，需谨慎操作，避免被认定为违法终止；
  
• 劳动者若认为用人单位违法，可申请劳动仲裁主张赔偿金。
  

如有具体案例或合同条款需分析，可直接向我提问，我会结合细节进一步解答。