结论：工资条上写着基本工资三千，而实际基本工资为3500，另外五百以其他方式发放，这种做法是否合法，需根据具体情况来判断，但一般情况下，只要整体工资不低于约定且发放方式合法合理，这种做法并不直接违法。不过，若这种发放方式存在规避法律、损害劳动者权益等情形，则可能不合法。

分析：

1. 工资构成与发放方式的合法性：

   • 工资可以由基本工资、奖金、津贴、补贴等多个部分构成。只要用人单位与劳动者约定的工资总额不低于当地最低工资标准，且各部分工资的发放符合双方约定及法律规定，那么工资的具体构成和发放方式就是合法的。
   • 在您的情况下，如果基本工资3500元中的3000元明确标注在工资条上，而另外500元以其他合法方式（如奖金、津贴等）发放，且这种发放方式在劳动合同或规章制度中有明确规定，同时整体工资不低于约定标准，那么这种做法就是合法的。

2. 可能存在的法律风险：

   • 如果用人单位通过拆分工资的方式，试图规避某些法律义务（如社保缴纳基数、经济补偿计算基数等），或者损害劳动者的合法权益（如降低实际收入、影响加班费计算等），那么这种做法就可能不合法。
   • 例如，如果用人单位将部分工资以“报销”等名义发放，且无法提供合法有效的报销凭证，就可能被视为偷逃社保费用或个人所得税，从而面临法律风险。

3. 劳动者的权益保护：

   • 作为劳动者，您有权要求用人单位提供完整的工资条，并明确标注各项工资的构成和发放方式。
   • 如果您对工资的发放方式有疑问或不满，可以与用人单位进行沟通协商，要求其提供合理的解释和调整方案。
   • 如果用人单位拒绝沟通或无法提供合理的解释，您可以向当地劳动监察部门投诉举报，或者通过劳动争议仲裁、诉讼等法律途径维护自己的合法权益。

建议：

• 建议您仔细审查自己的劳动合同和工资条，了解工资的构成和发放方式。
• 如果对工资的发放方式有疑问或不满，及时与用人单位进行沟通协商。
• 保留好相关证据（如工资条、劳动合同、沟通记录等），以备不时之需。
• 如有需要，可以直接向我咨询相关法律问题，我会为您提供专业的法律建议和帮助。