在认定劳动关系时，如果单位同意，人民法院一般会予以支持，但具体还需结合实际情况和证据来判断。以下从不同角度为你详细分析：
一、单位同意认定劳动关系的情况
双方无争议：如果用人单位和劳动者对于双方存在劳动关系这一事实均无异议，且用人单位在仲裁或诉讼过程中明确表示同意认定劳动关系，那么人民法院在审查相关证据后，通常会确认双方存在劳动关系。这种情况下，单位的同意起到了积极的证明作用，有助于法院快速、准确地作出判决。
证据充分：即使单位最初对认定劳动关系存在异议，但如果劳动者能够提供充分的证据证明双方存在劳动关系（如劳动合同、工资支付记录、工作证、考勤记录等），且这些证据得到了单位的认可或无法被单位有效反驳，那么人民法院也会倾向于认定双方存在劳动关系。在这种情况下，单位的同意（无论是初始的还是后续的）都进一步增强了证据的证明力。
二、单位不同意但法院仍可能认定劳动关系的情况
证据确凿：即使单位不同意认定劳动关系，但如果劳动者提供的证据确实充分、确凿，能够形成完整的证据链证明双方存在劳动关系，那么人民法院也会根据证据规则和法律规定，认定双方存在劳动关系。这种情况下，单位的不同意并不影响法院的判决。
单位未提供反驳证据：在劳动争议案件中，用人单位负有提供反驳证据的义务。如果单位虽然不同意认定劳动关系，但未能提供有效的反驳证据来推翻劳动者提供的证据，那么人民法院也会根据证据优势原则，认定双方存在劳动关系。
三、法律建议
保留证据：对于劳动者而言，在劳动关系存续期间，应当注意保留与劳动关系相关的证据，如劳动合同、工资支付记录、工作证、考勤记录等。这些证据在认定劳动关系时将起到至关重要的作用。
及时维权：如果劳动者与用人单位在劳动关系认定上存在争议，应当及时通过劳动仲裁或诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。在维权过程中，要积极配合仲裁机构或法院的调查和审理工作，提供充分的证据来支持自己的主张。
咨询专业律师：在处理劳动争议案件时，由于涉及的法律问题较为复杂且专业性强，因此建议劳动者咨询专业律师的意见。律师可以根据劳动者的具体情况和案件事实，提供有针对性的法律建议和维权方案。
如果你在劳动关系认定方面遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据你的具体情况和案件事实，为你提供专业、全面的法律服务。