企业一般不可以仅因求职者有案底而拒绝其子女入职，但特定行业或岗位可能存在例外。以下从不同角度为你详细分析：

一、一般情况下的法律原则

在大多数情况下，企业招聘应当遵循公平、公正、公开的原则，不得因求职者的家庭背景、个人经历（包括是否有案底）等因素而对其进行歧视。这是基于平等就业权的基本原则，旨在保障每一个求职者都能在同等条件下参与竞争，获得工作机会。因此，如果企业仅因求职者有案底就拒绝其子女入职，这种行为很可能构成就业歧视，违反了相关法律法规。

二、特定行业或岗位的例外情况

尽管一般原则如此，但在某些特定行业或岗位中，企业可能因法律法规的明确要求或出于对工作性质、安全等因素的考虑，对求职者的背景进行更为严格的审查。例如：

1. 涉及国家安全、公共安全等敏感领域的岗位：这些岗位对求职者的政治素质、道德品质等方面有较高要求，企业可能会要求求职者提供无犯罪记录证明等材料，以确保其符合岗位需求。但即便如此，这种审查也应当针对求职者本人，而非其家庭成员。

2. 法律法规明确规定的岗位：某些法律法规可能明确规定，特定岗位不得录用有犯罪记录的人员。但同样，这种限制也应当直接针对求职者本人，而非其子女或其他家庭成员。

三、企业的合理审查与求职者的权益保护

企业在招聘过程中，有权对求职者的背景进行合理审查，以确保其符合岗位要求和企业文化。但这种审查应当遵循合法、合理、必要的原则，不得侵犯求职者的隐私权、名誉权等合法权益。如果企业因求职者有案底而拒绝其子女入职，且无法提供合理理由或证据支持其决定，那么求职者有权依法维护自己的权益，包括向劳动监察部门投诉、提起劳动仲裁或诉讼等。

四、建议与总结

1. 对于企业而言：在招聘过程中应当遵循公平、公正、公开的原则，避免对求职者进行不必要的背景审查或歧视。如果因工作需要确实需要对求职者的背景进行审查，也应当确保审查的合法性和合理性，并尊重求职者的隐私权和名誉权。

2. 对于求职者而言：如果因家庭成员有案底而遭到企业的不公平对待，可以依法维护自己的权益。同时，也应当了解并尊重企业的合理审查需求，积极配合企业的招聘流程。

总之，企业一般不可以仅因求职者有案底而拒绝其子女入职。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。