针对原执行依据被撤销，再审作出新判决且部分款项已执行到位的情况，处理方式如下：

1. 执行回转的启动

   • 法律依据：根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第四百六十四条，若原生效法律文书被撤销且原执行程序已完毕或部分完毕，法院应裁定执行回转。这意味着，已执行的财产需返还给原被执行人。
   • 具体操作：执行法院将制作执行回转裁定书，并责令取得财产的人返还财产。若其拒不返还，法院可采取强制执行措施，如查封、扣押、拍卖等，以确保财产能够顺利回转。

2. 按新判决执行剩余款项

   • 新判决的效力：再审作出的新判决将替代原判决，成为具有法律效力的执行依据。新判决中明确的内容，如赔偿金额、履行期限等，将作为执行的标准。
   • 执行程序：对于新判决中未执行的部分，执行法院将根据新判决的内容继续执行。这可能包括向被执行人发出执行通知书，要求其履行义务；若被执行人拒不履行，法院可采取强制执行措施，如冻结银行账户、划拨存款、拍卖财产等。

3. 处理已执行到位款项

   • 款项返还：若已执行到位的款项属于执行回转的范围，即原判决被撤销后应返还给原被执行人的部分，执行法院将按照执行回转的程序，将款项返还给原被执行人。
   • 新判决调整：若新判决对已执行到位的款项有调整，如减少了赔偿金额，那么超出新判决金额的部分也应返还给原被执行人。若新判决增加了赔偿金额，则原被执行人需补足差额。

4. 相关费用的处理

   • 诉讼费用：再审改判后，原执行案件中产生的诉讼费用需根据改判结果处理。若诉讼费用负担发生变化，多交的部分将退还当事人。
   • 保全措施：因原判决错误而采取的保全措施，如查封、扣押、冻结等，应及时解除，以避免给当事人造成不必要的损失。

法律建议：

• 在处理此类案件时，建议当事人及时与执行法院沟通，了解执行回转和新判决执行的具体程序和要求。
• 若对执行回转或新判决的执行有异议，可依法向执行法院提出书面异议，要求法院进行审查并作出裁定。
• 在整个处理过程中，保留好相关证据和文件，如执行通知书、裁定书、转账记录等，以备不时之需。

可能法律后果：

• 若拒不履行执行回转或新判决确定的义务，可能面临法院的强制执行措施，如罚款、拘留等。
• 若对执行回转或新判决的执行有异议但未依法提出，可能丧失救济途径，导致自身权益受损。

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