在综合工时制下，年休假的计算与安排主要遵循《职工带薪年休假条例》及《企业职工带薪年休假实施办法》的相关规定，同时结合综合工时制的特点进行具体操作。以下是对综合工时制下年休假计算的详细解答：
一、享受年休假的条件
无论采用何种工时制度，职工只要连续工作满12个月以上，即有权享受带薪年休假。这里的“连续工作”不仅限于在同一用人单位，也包括在不同用人单位的工作时间累计。
二、年休假天数的计算
年休假天数的计算与职工的累计工作时间直接相关：
需要注意的是，国家法定休假日、休息日均不计入年休假范畴。
三、年休假在综合工时制下的安排
在综合工时制下，用人单位需根据生产、工作的具体情况，并考虑职工个人意愿，统筹安排年休假。年休假可以在1个年度内集中使用，也可以分段安排，但一般不得跨年度安排。特殊情况下，因工作需要确需跨年度安排的，应确保职工的年休假权益不受影响。
由于综合工时制的工作时间计算方式相对灵活，用人单位在安排年休假时，应充分考虑综合计算工时的周期特点，确保职工在综合计算周期内能够切实享受到年休假权益。例如，如果综合计算周期为季度，那么用人单位应确保职工在每个季度内都有机会享受年休假。
四、未休年休假的补偿
对于应休未休的年休假天数，用人单位应按照该职工日工资收入的300%支付年休假工资报酬，这包含了职工正常工作期间的工资收入。如果用人单位与职工解除或终止劳动合同，且当年度未安排职工休满应休年休假天数的，也应按此标准折算并支付未休年休假工资报酬。但折算后不足1整天的部分不支付未休年休假工资报酬。
五、综合工时制下的特殊考量
在综合工时制下，尽管工作时间计算方式相对灵活，但用人单位仍需严格遵守相关法律法规，确保职工的休息权益不受侵害。如果综合计算周期内某段时间的实际工作时间超过标准工作时间（如每日8小时或每周40小时），超出部分应视为加班，并按照《劳动法》的相关规定支付加班费。
示例说明
假设某企业实行以月为周期的综合计算工时制，员工小李累计工作已满10年不满20年，因此年休假为10天。在某个月份，由于生产需求，小李实际工作了180小时，而标准工时上限为166.64小时。超出的13.36小时属于加班时间。然而，这并不影响小李享受年休假的权利。用人单位应在该年度内为小李安排10天的年休假，或者按照相关规定支付未休年休假的工资报酬。
综上所述，综合工时制下的年休假计算与安排需严格遵循相关法律法规，并充分考虑综合计算工时的周期特点，以确保职工的合法权益得到充分保障。