公司总经理打折收购公司物资是否违法，不能一概而论，需要分情况讨论：
若总经理的打折收购行为符合公司章程或内部规定，且经过合法程序：
- 在这种情况下，总经理的打折收购行为可能是合法的。例如，公司可能出于清理库存、回笼资金等考虑，制定了相应的物资打折销售政策，总经理作为公司管理层，按照这一政策进行收购，且收购过程公开透明，没有损害公司和其他股东的利益，那么这种行为就是合法的。
若总经理的打折收购行为未经合法程序，或违反公司章程、内部规定，甚至存在利益输送、损害公司利益的情况：
- 在这种情况下，总经理的打折收购行为可能是违法的。根据《公司法》的相关规定，公司董事、高级管理人员应当遵守法律、行政法规和公司章程，对公司负有忠实义务和勤勉义务。如果总经理利用职权之便，以明显低于市场价的价格收购公司物资，且未经合法程序审批，或者存在其他损害公司利益的行为，那么这种行为就可能构成违法，甚至可能涉及职务侵占、贪污等犯罪行为。
- 具体来说，如果总经理的打折收购行为导致公司资产流失，损害了公司和其他股东的利益，公司或其他股东有权要求总经理承担赔偿责任。同时，如果总经理的行为涉嫌犯罪，公司或其他股东还可以向公安机关报案，要求追究其刑事责任。
法律建议：
- 对于公司而言，应当建立健全内部管理制度，明确物资销售、采购等流程，确保所有交易都经过合法程序审批，并留存相关记录。同时，公司应当加强对管理层人员的监督和管理，防止其利用职权之便损害公司利益。
- 对于总经理而言，应当严格遵守公司章程和内部规定，履行忠实义务和勤勉义务，不得利用职权之便谋取私利。如果需要进行物资收购等交易，应当按照公司规定的程序进行审批和操作，确保交易的合法性和公正性。
可能后果：
- 如果总经理的打折收购行为被认定为违法或犯罪，其可能面临民事赔偿、行政处罚甚至刑事处罚等后果。同时，这种行为也可能对总经理的职业声誉和未来发展产生负面影响。
总结：公司总经理打折收购公司物资是否违法，取决于其行为是否符合公司章程、内部规定以及是否经过合法程序审批。如果行为合法合规，则不构成违法；如果行为违法违规，则可能面临法律责任。因此，建议公司在处理此类事务时务必谨慎操作，确保所有交易都合法合规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。