小公司的经理拿回扣是违法的，但具体违法性质和后果需根据实际情况判断。以下从不同角度为你详细分析：
一、违法性质
职务侵占罪：
- 如果经理利用职务上的便利，将公司财物非法占为己有，数额较大的，可能构成职务侵占罪。回扣如果被视为公司财物的一部分，且经理通过不正当手段获取并占为己有，就符合这一罪名的构成要件。
非国家工作人员受贿罪：
- 如果经理在业务往来中，利用职务上的便利，索取他人财物或者非法收受他人财物，为他人谋取利益，且数额较大的，可能构成非国家工作人员受贿罪。这里的“他人财物”可以包括回扣等不正当利益。
商业贿赂：
- 从商业道德和市场竞争的角度来看，拿回扣也属于商业贿赂的一种形式。虽然商业贿赂不一定直接构成刑事犯罪，但它违反了商业道德和市场竞争原则，可能受到行政处罚，如罚款、吊销营业执照等。同时，如果商业贿赂行为情节严重，也可能触犯刑法中的相关罪名。
二、法律后果
刑事责任：
- 如果经理的行为构成职务侵占罪或非国家工作人员受贿罪，将面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役、罚金等。具体刑罚将根据犯罪情节的严重程度、涉案金额的大小等因素来决定。
民事责任：
- 除了刑事责任外，经理还可能面临民事责任。如果其行为给公司造成了经济损失，公司有权要求经理进行赔偿。这种赔偿可能包括直接经济损失和间接经济损失，如因经理行为导致的公司声誉受损、业务机会丧失等。
行政责任：
- 如果经理的行为被认定为商业贿赂，还可能受到行政处罚。行政处罚的种类和幅度将根据违法行为的性质、情节以及社会危害程度等因素来决定。
三、实际案例与判断
- 在实际案例中，判断经理拿回扣是否违法，需要综合考虑多个因素，如回扣的来源、性质、金额大小、经理的行为方式等。如果回扣是供应商为了获取业务而主动给予经理的，且经理通过不正当手段获取并占为己有，那么这种行为很可能构成违法。
- 另外，即使回扣的金额不大，但如果经理的行为违反了公司的规章制度或者职业道德规范，也可能受到公司的内部处罚，如警告、罚款、解雇等。
四、建议与措施
加强内部管理：
- 公司应建立健全的内部控制制度，加强对经理等关键岗位人员的监督和管理，防止类似行为的发生。
提高法律意识：
- 公司应加强对员工的法律培训和教育，提高员工的法律意识和职业道德水平，使员工明确知道拿回扣等行为的违法性和危害性。
及时采取措施：
- 如果发现经理有拿回扣等违法行为，公司应及时采取措施进行调查和处理，必要时可以向公安机关报案，维护公司的合法权益。
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