《企业职工奖惩条例》已于2008年1月15日被废止，因此，对于该条例废止前发生的违法行为，在条例废止后，不能再直接适用该条例进行处理。不过，我们可以从以下几个角度来详细分析这一问题：

一、法律废止后的效力问题

1. 法律废止的基本原则：

   • 当一部法律或行政法规被废止后，其法律效力即告终止，不再适用于废止后的行为或事件。
   • 对于废止前发生的行为或事件，如果当时有效的法律或行政法规有明确规定，且该规定未被新的法律或行政法规所替代或修改，则仍可适用当时的法律或行政法规进行处理。但在此情况下，由于《企业职工奖惩条例》已被明确废止，且没有新的法律或行政法规直接替代其全部或部分内容，因此，对于该条例废止前发生的违法行为，在条例废止后，不能再直接适用该条例。

2. 具体到本问题的分析：

   • 既然《企业职工奖惩条例》已被废止，那么对于该条例废止前发生的违法行为，如果当时未依据该条例进行处理，或者处理程序未完成，那么在条例废止后，就不能再依据该条例继续进行处理。
   • 如果当时已经依据该条例作出了处理决定，且该决定已经生效并执行完毕，那么该决定的法律效力不受条例废止的影响。但如果处理决定尚未执行完毕，或者存在争议需要重新处理，那么就需要依据现行有效的法律、法规或企业规章制度来处理。

二、现行法律框架下的处理方式

1. 依据现行法律法规处理：

   • 目前，企业对于职工的奖惩相关事宜主要依据《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》以及企业依法制定并公示的规章制度。
   • 对于废止前发生的违法行为，如果当时未处理或处理未完成，现在应依据这些现行有效的法律、法规和企业规章制度来重新审视和处理。

2. 企业规章制度的制定与适用：

   • 企业应依法制定并公示内部的奖惩规章制度，这些制度应详细规定奖惩的种类、条件、程序等，确保奖惩管理的合法性和公正性。
   • 对于废止前发生的违法行为，如果企业规章制度中有相关规定，且该规定不违反现行法律法规的强制性规定，那么可以依据企业规章制度进行处理。

三、实际操作中的建议

1. 审查当时的行为与处理情况：

   • 首先，需要审查废止前发生的违法行为的具体情况，包括行为性质、严重程度、是否已作出处理决定等。
   • 如果当时已经作出了处理决定，且该决定已经生效并执行完毕，那么一般无需再进行处理。

2. 依据现行法律与企业规章制度处理：

   • 如果当时未处理或处理未完成，那么应依据现行有效的法律、法规和企业规章制度来重新审视和处理。
   • 在处理过程中，应确保程序的合法性和公正性，充分保障职工的合法权益。

3. 加强沟通与协商：

   • 在处理过程中，企业应加强与职工的沟通与协商，尽量通过协商达成一致意见，避免不必要的法律纠纷。

总结来说，对于《企业职工奖惩条例》废止前发生的违法行为，在条例废止后，不能再直接适用该条例进行处理。而应依据现行有效的法律、法规和企业规章制度来重新审视和处理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。