在发回重审的案件中，通常不能提出诉讼时效抗辩，但存在特定例外情况。以下是对此问题的详细分析：
一、一般原则
诉讼时效抗辩的提出时机：
- 根据《最高人民法院关于审理民事案件适用诉讼时效制度若干问题的规定》第三条，当事人在一审期间未提出诉讼时效抗辩，在二审期间提出的，人民法院不予支持，除非其基于新的证据能够证明对方当事人的请求权已过诉讼时效期间。这一规定同样适用于发回重审的情况，即若当事人在原审一审期间未提出诉讼时效抗辩，原则上在重审时也不能随意提出。
发回重审的性质：
- 发回重审并非一个独立的审级，而是原一审程序的延续。因此，在发回重审的案件中，当事人不能重新提出在一审时已经放弃或未提出的诉讼时效抗辩，以维护诉讼程序的稳定性和效率性。
二、特定例外情况
新证据的出现：
- 如果当事人在发回重审期间提出了基于新证据的诉讼时效抗辩，且该新证据能够证明对方当事人的请求权已过诉讼时效期间，那么法院可能会支持这一抗辩。例如，被告在重新审理过程中找到了新的证据，如证人证言或书面材料，能证明原告在借款到期后很长时间内从未向其主张过权利，此时被告就可以基于该新证据提出诉讼时效抗辩。
一审法院未对诉讼时效问题进行审理和裁判存在错误：
- 如果二审法院认为一审法院未对诉讼时效问题进行审理和裁判存在错误，或者一审法院违反法律规定导致当事人未行使诉讼时效抗辩权的，二审法院可以在查清事实后对诉讼时效问题作出改判，或者直接改判驳回原告的诉讼请求。这种情况下，发回重审后，被告也有权提出诉讼时效抗辩。
三、实际操作建议
充分准备证据：
- 如果当事人希望在发回重审时提出诉讼时效抗辩，应尽可能收集并准备相关证据，特别是能够证明对方请求权已过诉讼时效期间的新证据。
咨询专业律师（此条根据约束条件调整为）：
- 在实际操作中，涉及诉讼时效抗辩的问题往往较为复杂，建议当事人直接向我咨询，以便根据具体情况制定合适的诉讼策略。
注意提出抗辩的时机：
- 当事人应在一审期间就提出诉讼时效抗辩，如果因故未能提出，且没有新的证据支持，那么在发回重审时再提诉讼时效抗辩将面临较大的法律风险。
综上所述，发回重审案件通常不能提出诉讼时效抗辩，但如存在新证据支持或一审法院未对诉讼时效问题进行审理和裁判存在错误等特定情况时，法院可能会考虑接受该抗辩。因此，当事人在处理此类案件时，应充分了解相关法律规定和司法实践原则，以便更好地维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。