员工虚造考勤侵占公司资金的行为，公司不能直接对其进行罚款，但可以依据相关法律法规和劳动合同约定，要求员工赔偿经济损失。以下是对此问题的详细分析：
一、罚款的合法性及依据
- 罚款的合法性：根据《中华人民共和国劳动法》及相关法律法规，企业并不具备直接对员工进行罚款的法定权利。罚款是行政处罚的一种，而企业并非行政机关，因此无权直接对员工实施罚款。
- 合法扣除工资的情形：然而，如果员工因虚造考勤等个人原因给用人单位造成经济损失，公司可以按照劳动合同的约定或公司规章制度（需合法合规）要求员工赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但需遵循一定的限制条件。
二、赔偿的具体规定
- 扣除工资的限制：根据《工资支付暂行规定（2004年修订）》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
计算公式：
- 每月可扣除的最大金额 = 员工当月工资 × 20%
- 扣除后剩余工资 = 员工当月工资 - 每月可扣除的最大金额（若此值低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付）
- 赔偿金额的确定：赔偿金额应基于员工虚造考勤给公司造成的实际经济损失进行合理确定。公司应避免随意设定赔偿金额，以免构成克扣工资。
三、公司处理流程与建议
- 明确赔偿依据：在要求员工赔偿经济损失前，公司应确保有明确的劳动合同约定或公司规章制度作为依据，且这些约定或制度需合法合规，不得违反国家法律法规。
- 与员工沟通协商：公司应与员工进行充分沟通，解释赔偿的原因和依据，并听取员工的意见和解释。通过协商达成一致的赔偿方案，有助于维护公司与员工之间的和谐关系。
- 遵循扣除程序：在扣除员工工资作为赔偿时，公司应遵循《工资支付暂行规定》中的程序要求，即每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，并确保剩余工资部分不低于当地月最低工资标准。
- 考虑员工权益保护：员工在面对赔偿要求时，有权了解自己的权益和赔偿的合法性。若认为赔偿不合理或存在争议，员工可向企业劳动争议调解委员会申请调解，或直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
四、可能的法律后果
- 若公司违法扣除工资：如果公司违反法律法规或劳动合同约定，随意扣除员工工资作为赔偿，员工有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司支付被扣除的工资及可能的赔偿金。
- 若员工行为构成犯罪：如果员工虚造考勤侵占公司资金的行为情节严重，构成犯罪（如挪用资金罪、职务侵占罪等），公司应向公安机关报案，由司法机关依法追究员工的刑事责任。
总结来说，对于员工虚造考勤侵占公司资金的行为，公司应依据相关法律法规和劳动合同约定，通过合法途径要求员工赔偿经济损失。在处理过程中，公司应确保赔偿依据的合法性、赔偿金额的合理性、扣除程序的合规性，并加强与员工的沟通与协商。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。