若检察院已通知被害人写谅解书，但后续被告不配合，核心结论是：被害人可采取多种法律措施维护自身权益，具体如下：
明确谅解书的法律性质与作用
谅解书本质上是被害人对被告犯罪行为的谅解表示，属于刑事诉讼中的量刑情节参考，但并非被告必须履行的法律义务。被告不配合签署谅解书，不直接导致其承担法律责任，但可能影响其量刑幅度（如无法获得从轻或减轻处罚）。被害人需明确：谅解书的签署需自愿，被告无强制配合义务，但可通过其他途径推动案件进展。
被害人可采取的应对措施
- 向检察院或法院反馈被告态度：若被告明确拒绝配合，被害人可向办案机关（检察院或法院）说明情况，强调被告缺乏悔罪表现，请求在量刑时予以考量。根据《刑事诉讼法》及相关司法解释，被告的悔罪态度是量刑的重要情节，被告拒绝签署谅解书可能被认定为未真诚悔罪，从而影响其量刑结果。
- 坚持刑事追责程序：谅解书并非刑事案件的必经程序，被告不配合不影响案件的刑事诉讼进程。被害人可要求检察院继续推进公诉程序，由法院根据事实和法律对被告定罪量刑。若被告行为构成犯罪，即使无谅解书，法院仍可依法判处刑罚。
- 提起附带民事诉讼主张赔偿：若被害人因被告的犯罪行为遭受物质损失，可在刑事诉讼中提起附带民事诉讼，要求被告赔偿医疗费、误工费、财产损失等。被告是否签署谅解书不影响民事赔偿的认定，法院将根据证据和法律规定判决赔偿金额。
特殊情形下的处理建议
- 若被告以赔偿为条件要求签署谅解书但未履行：部分被告可能口头承诺赔偿以换取谅解书，但实际未履行。此时被害人可拒绝签署谅解书，并保留被告承诺的证据（如录音、聊天记录），在刑事诉讼中作为被告缺乏诚意的证明，或在民事诉讼中作为主张赔偿的依据。
- 若被告通过威胁、胁迫等方式阻止签署谅解书：被害人应立即向公安机关报案，要求保护人身安全，并说明被告的妨害行为。根据《刑法》第三百零七条，以暴力、威胁、贿买等方法阻止证人作证或指使他人作伪证的，可能构成妨害作证罪，被告将面临刑事处罚。
总结：被告不配合签署谅解书不影响刑事案件的定性，但可能影响其量刑。被害人应通过合法途径维护权益，包括向办案机关反馈、坚持刑事追责、提起附带民事诉讼等。若遇特殊情形（如威胁、虚假承诺），需及时固定证据并寻求法律保护。如有进一步疑问，可直接向我咨询。