结论前置：事业单位将事假从年假里扣除是否违法，需分情况讨论，不能一概而论。

1. 若单位规章制度或劳动合同中有明确规定：

   • 情况说明：如果事业单位的规章制度或与员工签订的劳动合同中明确规定了事假可以抵扣年假，且该规定不违反国家法律法规的强制性规定，那么这种做法通常是合法的。因为单位有权根据自身的实际情况和需要，制定合理的规章制度来管理员工，包括请假制度。
   • 法律依据：虽然直接的法律依据可能并不明确提及事假可以抵扣年假，但根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同的内容。如果规章制度或劳动合同中的相关条款是双方协商一致的结果，且不违反法律、行政法规的强制性规定，那么这些条款就是有效的。

2. 若单位规章制度或劳动合同中没有明确规定，或规定违反法律法规：

   • 情况说明：如果事业单位的规章制度或劳动合同中没有明确规定事假可以抵扣年假，或者该规定违反了国家法律法规的强制性规定（如侵犯了员工的休息休假权利），那么这种做法就是违法的。员工有权拒绝这种不合理的规定，并可以向相关部门投诉或寻求法律援助。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者享有休息休假的权利，用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日，并依法安排劳动者享受带薪年休假。如果用人单位的规定侵犯了劳动者的这些权利，那么这些规定就是无效的。

3. 特殊情况下的考虑：

   • 情况说明：在某些特殊情况下，如员工因个人原因需要长时间请假，且该请假时间远远超出了其应享受的年假天数，单位可能会与员工协商，将部分事假抵扣年假。但这种做法必须基于双方的协商一致，且不能违反法律法规的强制性规定。
   • 建议：在这种情况下，建议员工与单位进行充分沟通，明确双方的权利和义务，并尽量达成书面协议，以避免后续产生纠纷。

法律建议：

• 如果您对事业单位将事假从年假里扣除的做法有疑问或不满，建议首先查阅单位的规章制度和与您签订的劳动合同，了解相关规定。
• 如果您认为单位的规定违反了法律法规或侵犯了您的合法权益，可以向单位的人力资源部门或工会反映情况，寻求内部解决。
• 如果内部解决无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。

可能后果：

• 如果单位的规定合法且您接受了该规定，那么您需要按照规定执行，否则可能会面临单位的纪律处分或法律责任。
• 如果单位的规定违法或侵犯了您的合法权益，且您未采取任何措施维护自己的权益，那么您可能会继续遭受不公平的待遇或损失。因此，建议您及时采取行动，维护自己的合法权益。