公司因性别原因在工资发放上区别对待女性员工，是违法的。以下从不同角度为你详细分析：

法律背景

根据《中华人民共和国劳动法》以及《中华人民共和国妇女权益保障法》的相关规定，劳动者享有平等的就业和选择职业的权利，不因民族、种族、性别、宗教信仰等不同而受歧视。在工资分配方面，用人单位应当遵循按劳分配的原则，实行同工同酬，不得因性别等原因对劳动者进行不合理的差别对待。

具体分析

1. 同工同酬原则：

   • 同工同酬是指用人单位对于技术和劳动熟练程度相同的劳动者在从事同种工作时，不分性别、年龄、民族、区域等差别，只要提供相同的劳动量，就获得相同的劳动报酬。
   • 如果公司因为性别原因，对女性员工支付低于男性员工的工资，即使她们的工作内容、工作量、工作技能等完全相同，这也违反了同工同酬的原则。

2. 性别歧视的认定：

   • 性别歧视不仅限于直接的工资差异，还包括在招聘、晋升、培训、福利等方面的差别对待。
   • 如果公司能够证明其工资差异是基于合理的非性别因素（如工作经验、教育背景、工作绩效等），则可能不构成性别歧视。但若无法提供合理理由，仅因性别而区别对待，则很可能被认定为性别歧视。

3. 法律后果：

   • 如果女性员工认为公司存在性别歧视，可以向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求公司纠正违法行为并赔偿损失。
   • 公司若被认定存在性别歧视行为，可能面临行政处罚、民事赔偿以及声誉损害等后果。

实际建议

• 保留证据：如果你作为女性员工认为公司存在性别歧视，应尽可能保留相关证据，如工资条、工作记录、同事证言等，以便在需要时证明自己的主张。
• 寻求帮助：你可以向公司的工会或人力资源部门反映情况，要求公司进行调查并纠正违法行为。如果公司不予理会或处理不当，你可以向当地的劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。
• 法律途径：在必要时，你可以咨询专业律师（比如我，段飞龙律师，专注于劳动仲裁等领域），通过法律途径维护自己的合法权益。

总之，公司因性别原因在工资发放上区别对待女性员工是违法的，女性员工有权维护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。