施工合同纠纷属于专属管辖范畴，但有不同被告时，不能直接选择其中之一的被告所在地法院管辖，而应遵循专属管辖的规定，由不动产所在地法院管辖。以下是对此问题的详细分析：
一、施工合同纠纷的专属管辖规定
根据《中华人民共和国民事诉讼法》第三十四条的规定，下列案件，由本条规定的人民法院专属管辖：
（一）因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院管辖； （二）因港口作业中发生纠纷提起的诉讼，由港口所在地人民法院管辖； （三）因继承遗产纠纷提起的诉讼，由被继承人死亡时住所地或者主要遗产所在地人民法院管辖。
在建设工程合同纠纷中，由于工程通常涉及不动产（如建筑物、构筑物等），因此这类纠纷往往被视为不动产纠纷，从而适用专属管辖的规定。也就是说，施工合同纠纷应由不动产所在地的人民法院管辖。
二、有不同被告时管辖法院的选择
当施工合同纠纷中有多个被告时，管辖法院的选择并不能简单地依据被告所在地来确定。因为专属管辖的规定已经明确了管辖法院，即不动产所在地的人民法院。这一规定排除了其他法院（包括被告所在地法院）的管辖权。
举例说明：假设一个施工合同纠纷中，原告与两个被告（一个是施工单位，一个是建设单位）存在争议，且这两个被告分别位于不同的地区。根据专属管辖的规定，原告不能选择其中之一的被告所在地法院提起诉讼，而应向不动产所在地的人民法院提起诉讼。
三、特殊情况下的管辖问题
虽然施工合同纠纷通常适用专属管辖的规定，但也存在一些特殊情况。例如，如果施工合同中明确约定了管辖法院，且该约定不违反专属管辖和级别管辖的规定，那么双方应按照约定履行。然而，在大多数情况下，施工合同纠纷的管辖法院还是由不动产所在地的人民法院确定。
四、法律建议
如有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我提问。