建筑工程合同纠纷的管辖并不完全取决于被告所在地，而是需要根据具体情况来判断，特别是要考虑到专属管辖的规定。以下是对这一问题的详细分析：
一、一般规定
根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，因合同纠纷提起的诉讼，通常由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。在建筑工程合同纠纷中，这通常意味着原告可以选择向被告住所地或合同履行地的法院提起诉讼。然而，这一规定并非绝对，因为建筑工程合同纠纷往往涉及不动产，从而可能受到专属管辖的限制。
二、专属管辖的特殊规定
不动产专属管辖：
- 根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第二十八条第二款，建设工程施工合同纠纷按照不动产纠纷确定管辖。而不动产纠纷由不动产所在地人民法院专属管辖。因此，在建筑工程施工合同纠纷中，应由工程所在地的人民法院专属管辖，而非单纯依据被告所在地。
级别管辖的考虑：
- 除了地域管辖外，还需要考虑级别管辖。基层人民法院通常管辖大多数建筑工程合同纠纷案件，但对于重大涉外案件、在本辖区有重大影响的案件，以及最高人民法院确定由中级人民法院管辖的案件，则可能由中级人民法院管辖。
三、协议管辖的适用与限制
- 协议管辖的适用：在不违反级别管辖和专属管辖的前提下，合同当事人可以在书面合同中协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民法院管辖。
- 协议管辖的限制：然而，在建筑工程施工合同纠纷中，由于涉及不动产的专属管辖，当事人不能通过协议改变这种管辖。即，即使合同中有关于管辖的约定，如果该约定违反了专属管辖的规定，也是无效的。
四、实际案例说明
假设A公司与B公司签订了一份建设工程施工合同，约定由B公司为A公司在C市建造一座办公楼。后双方发生纠纷，A公司欲提起诉讼。在此情况下：
- A公司不能单纯选择向B公司的住所地（如D市）的人民法院提起诉讼，因为该纠纷属于建设工程施工合同纠纷，且涉及不动产，应由C市的人民法院专属管辖。
- 如果合同中有关于管辖的约定，但该约定违反了专属管辖的规定（如约定由D市法院管辖），则该约定无效，A公司仍应向C市的人民法院提起诉讼。
五、法律建议
- 在签订建筑工程合同时，当事人应充分考虑管辖问题，明确、合理地约定管辖条款（在不违反专属管辖的前提下），以避免后续在管辖问题上产生不必要的争议。
- 如果合同中没有约定管辖法院，或者约定不符合法律规定（如违反了专属管辖），那么将依据《民事诉讼法》的相关规定来确定管辖法院。
综上所述，建筑工程合同纠纷的管辖并不完全取决于被告所在地，而是需要根据具体情况来判断，特别是要考虑到专属管辖的规定。如果您在建筑工程合同纠纷中遇到管辖问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。