针对您提出的“工程结算后对方有意见起诉合同联系人还是公司”的问题，以下是我的详细解答：

1. 起诉对象的选择依据：

   • 合同主体：首先，需要明确的是，工程结算合同是公司与对方（可能是另一家公司或个人）之间签订的。因此，从合同法律关系的角度来看，公司是合同的直接主体，应当承担合同约定的权利和义务。
   • 合同联系人的角色：合同联系人通常是公司内部负责与对方沟通、协调合同履行事宜的人员。他们虽然参与了合同的履行过程，但并非合同的直接主体，不承担合同约定的法律责任。

2. 起诉公司的理由：

   • 合同责任：如果对方对工程结算有意见，且认为公司存在违约行为（如未按照合同约定支付款项、结算金额存在争议等），那么对方有权起诉公司，要求公司承担相应的违约责任。
   • 法律程序：在法律程序中，起诉公司是符合合同法律关系和诉讼程序的做法。法院将根据合同约定、双方提供的证据以及相关法律法规来审理案件，并作出判决。

3. 起诉合同联系人的可能性及后果：

   • 可能性较低：从法律角度来看，起诉合同联系人的可能性较低。因为合同联系人并非合同的直接主体，不承担合同约定的法律责任。除非能够证明合同联系人在履行合同过程中存在故意或重大过失，且这种过失与对方的损失之间存在直接的因果关系，否则对方起诉合同联系人的请求可能不会被法院支持。
   • 法律后果：即使对方起诉了合同联系人，且法院最终认定合同联系人存在过错，合同联系人也通常只承担与其过错程度相适应的赔偿责任，而非承担全部合同责任。

4. 建议：

   • 公司应对：如果公司收到对方的起诉状，应当及时组织法律团队进行应对，准备相关证据和答辩材料，以维护公司的合法权益。
   • 合同联系人：作为合同联系人，虽然不直接承担合同责任，但也应当积极配合公司的法律应对工作，提供必要的协助和信息。
   • 预防措施：为了避免类似的纠纷发生，公司在签订工程结算合同时应当明确双方的权利和义务，确保合同条款清晰、具体、可执行。同时，在合同履行过程中也应当加强沟通和协调，及时解决可能出现的问题。

综上所述，工程结算后对方有意见时，应当起诉公司而非合同联系人。如果您在工程结算或合同履行过程中遇到任何法律问题，欢迎直接向我咨询。