工程结算有争议时，双方可以通过协商、调解、仲裁或诉讼等多种途径来解决。以下是从不同角度对这一问题的详细解答：
一、协商解决
自行协商：
- 定义与特点：自行协商是解决工程结算争议的首选方式，它灵活、高效，能够节省时间和成本，同时有助于维护双方当事人的友好合作关系。
- 操作建议：发包人与承包人应直接沟通，就争议问题如工程变更、工程量计算及计价方式进行深入交流，力求在互谅互让的基础上达成一致，并签署书面结算协议以固化成果。
第三方调解：
- 定义与特点：若自行协商难以奏效，可引入第三方调解。双方信任的第三方，如行业协会、专业调解机构或业内权威人士，能凭借其专业知识与中立立场，提出公正合理的解决方案，促进双方和解。
- 操作建议：在选择第三方调解时，应确保调解机构的权威性和专业性，以便更有效地解决争议。
二、行政介入
- 定义与特点：对于涉及政府投资或国有资金的工程项目，当事人可向相关行政主管部门求助。这些部门将依据法规政策对结算争议进行调解，推动问题有效解决。
- 操作建议：在向行政主管部门求助时，应准备好相关证据材料，以便部门能够更准确地了解争议情况并作出调解。
三、法律途径
仲裁：
- 定义与特点：若合同中包含仲裁条款或双方事后达成仲裁协议，可将争议提交至约定的仲裁机构裁决。仲裁以其专业性、高效性、保密性及终局性著称，是解决工程结算争议的理想选择。
- 法律依据：根据《中华人民共和国仲裁法》第二条，平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。
- 操作建议：在选择仲裁时，应确保仲裁协议的合法性和有效性，并按照仲裁规则进行仲裁程序。
诉讼：
- 定义与特点：若未约定仲裁或仲裁无果，任何一方均可向有管辖权的人民法院提起诉讼。诉讼过程虽复杂且耗时较长，但法院判决具有权威性和强制性，能确保争议得到最终解决。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》等相关法律法规，当事人有权向人民法院提起诉讼，由人民法院依法审理并作出判决。
- 操作建议：在提起诉讼前，应收集好相关证据材料，并准备好起诉状等法律文书。在诉讼过程中，应积极配合法院的审理工作，并遵守诉讼程序。
- 证据收集：在诉讼中，证据的收集与提交至关重要。包括合同文件、施工图纸、变更通知、竣工资料、审计报告等相关证据，以便在诉讼过程中有力维护自身权益。
四、专业鉴定与评估
- 工程造价鉴定：当双方对工程量计算、计价依据存在重大分歧时，可委托具有资质的造价咨询机构进行司法鉴定。鉴定报告需经法庭质证后方可作为有效证据。
- 质量责任认定：若因工程质量问题引发结算争议，需通过质量检测机构出具专业报告。根据检测结果划分责任归属。
五、特殊情形处理建议
- “黑白合同”问题：严格遵循《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》规定，以备案的中标合同作为结算依据。
- 审计争议应对：明确合同约定是否以政府审计结果为结算依据。对审计结论有异议时可申请行政复议或提起行政诉讼。
- 优先受偿权行使：在法定期限内（通常为六个月）主张建设工程价款优先受偿权。确保债权范围包含利息、违约金等从权利。
总结与建议：工程结算争议的解决需综合考虑多种途径与方法。双方应根据具体情况灵活选择最适合的解决方式，以确保争议得到公正、高效、和谐的解决。在处理争议过程中，双方应保持冷静与理性，优先通过友好协商解决争议；若协商无果，再考虑通过调解、仲裁或诉讼等法律途径解决。同时，双方应妥善保存相关证据材料，以便在争议解决过程中有力维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。