关于建房协议上公证书见证人未在场按手印的合法性问题，结论如下：
公证书见证人未在场按手印，一般不影响公证书本身的法律效力
- 公证书是由公证机构根据法定程序出具的，具有法律上的证明力。其法律效力主要取决于公证过程是否符合法定要求，如公证员的资质、公证程序的合法性等，而非单纯取决于见证人是否在场。
- 见证人未在场按手印，可能涉及的是见证程序上的瑕疵，但这并不直接导致公证书无效。除非这种瑕疵严重影响了公证事项的真实性或合法性，且被相关方提出异议并得到法院或公证机构的认可。
若见证人未在场按手印导致公证事项真实性存疑，可能影响相关法律行为的效力
- 在某些情况下，如建房协议涉及重大财产权益或需要高度信任的场合，见证人的在场和确认可能被视为协议有效性的重要条件。如果见证人未在场按手印，且这一事实被用来质疑公证事项的真实性，那么相关法律行为的效力可能会受到影响。
- 例如，如果建房协议因见证人未在场按手印而被认为存在欺诈、胁迫等情形，导致协议内容并非双方真实意思表示，那么该协议可能被认定为无效或可撤销。
建议采取的措施
- 核实公证书内容：首先，应仔细核对公证书的内容，确保其准确反映了双方的真实意思表示和公证事项的真实情况。
- 咨询公证机构：如果对公证书的效力或见证程序存在疑问，可以咨询出具公证书的公证机构，了解其对此类情况的看法和处理方式。
- 寻求法律救济：如果因见证人未在场按手印导致相关法律行为受到质疑或影响，且双方无法协商解决，可以寻求法律救济，如通过诉讼或仲裁等方式解决争议。
法律背景与建议：
- 根据《中华人民共和国公证法》的相关规定，公证机构应当依法履行公证职责，确保公证事项的真实性、合法性。见证人作为公证过程的一部分，其在场和确认有助于增强公证事项的可信度。然而，见证人未在场按手印并不直接导致公证书无效，除非这种瑕疵严重影响了公证事项的真实性或合法性。
- 在实际操作中，建议双方在签订建房协议等重要文件时，确保所有相关方（包括见证人）都在场并确认协议内容。如果因特殊原因见证人无法在场，可以考虑通过其他方式（如视频见证、书面确认等）来确保协议的真实性和合法性。
可能法律后果：
- 如果因见证人未在场按手印导致建房协议被认定为无效或可撤销，双方可能需要重新协商协议内容或承担因协议无效而产生的法律责任。
- 在极端情况下，如果因见证程序瑕疵导致公证事项被撤销或认定无效，且这一结果对一方造成重大损失，受损方可能有权要求责任方承担赔偿责任。
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