若员工与公司就转正工资不按offer上数额执行但已协商一致的情况，一般不构成违法。不过，这一结论需结合具体情况进行深入分析，以下从不同角度进行阐述：

一、协商一致的法律效力

1. 《中华人民共和国劳动法》第十七条规定，订立和变更劳动合同，应当遵循平等自愿、协商一致的原则。这意味着，如果员工与公司就转正工资进行了协商，并达成了双方都能接受的解决方案，那么这种协商结果是具有法律效力的。
2. 协商一致的前提：协商过程必须基于平等自愿，且不得违反法律法规的强制性规定。如果协商过程中存在欺诈、胁迫等情形，那么协商结果可能无效。

二、可能存在的违法情形

尽管协商一致通常具有法律效力，但在某些特定情况下，即使协商一致，也可能构成违法：

1. 低于最低工资标准：如果协商后的转正工资低于当地最低工资标准，那么这种协商结果是违法的。因为《中华人民共和国劳动法》第四十八条明确规定，用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。
2. 未明确约定或违反offer核心条款：虽然offer本身不具有劳动合同的法律效力，但如果其中包含了明确的薪资条款，且该条款是员工接受职位的重要条件，那么公司在未经员工同意的情况下擅自降低薪资，可能构成对offer的违约。不过，如果双方已经通过协商达成了新的薪资协议，且该协议不违反法律法规的强制性规定，那么通常不再视为违法。

三、应对建议

1. 保留证据：无论协商结果如何，员工都应保留好offer、劳动合同、工资条等相关证据，以备不时之需。
2. 明确协商内容：在协商过程中，员工应明确表达自己的诉求和期望，并确保协商结果以书面形式固定下来，避免后续产生争议。
3. 寻求法律帮助：如果员工对协商结果有异议，或者认为公司存在违法行为，可以及时向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议和支持。

四、预防措施

1. 仔细审查劳动合同：在签订劳动合同时，员工应仔细审查薪资条款，确保其明确性，包括薪资数额、支付方式、支付时间等。
2. 及时沟通：如果员工发现转正工资与offer不符，应及时与公司沟通并要求明确原因。如果公司无法给出合理解释或拒绝协商，员工可以考虑采取法律途径维护自己的合法权益。

总结来看，若员工与公司就转正工资不按offer上数额执行但已协商一致，且协商结果不违反法律法规的强制性规定（如不低于最低工资标准），那么这种协商结果通常是具有法律效力的。不过，为了确保自身权益不受损害，员工在协商过程中应保留好相关证据，并明确协商内容。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。