在差额拨款的事业单位发不出工资的情况下，并没有明确的法律规定要求必须先保证在编人员的工资。这一问题的处理涉及多个方面，以下从不同角度进行详细分析：
一、法律法规角度
《中华人民共和国劳动法》与《中华人民共和国劳动合同法》：
- 这两部法律主要规范了企业与劳动者之间的劳动关系，对于事业单位，特别是差额拨款的事业单位，其适用性可能受到一定限制。事业单位通常遵循的是更为专门的人事管理法规。
- 即便如此，从劳动法的基本原则出发，所有劳动者，无论是否在编，都应享有平等的劳动报酬权。因此，在发不出工资的情况下，单纯优先保证在编人员工资可能涉及对非在编人员权益的侵害。
事业单位人事管理法规：
- 差额拨款的事业单位在人事管理上可能遵循特定的地方性或行业性法规。这些法规可能对工资发放的优先级有所规定，但通常不会明确要求优先保证在编人员工资。
- 事业单位应依据其内部规章制度和人事管理政策来处理工资发放问题，这些规章制度和政策应确保公平、公正，避免对特定群体造成不公平待遇。
二、实际操作角度
资金筹措与分配：
- 在发不出工资的情况下，差额拨款的事业单位应积极筹措资金，如通过申请财政补助、调整预算、削减非必要开支等方式。
- 在资金分配上，应优先考虑所有员工的生存需求和基本生活保障，而非单纯基于在编与否进行分配。
沟通与协商：
- 事业单位应与员工进行充分沟通，解释资金困难的原因和解决方案，寻求员工的理解和支持。
- 通过协商，可以探索临时性的工资调整方案，如分期支付、降低部分工资等，以共渡难关。
三、法律后果与风险防范
法律后果：
- 如果差额拨款的事业单位在发不出工资的情况下，单纯优先保证在编人员工资，可能面临非在编人员的法律诉讼，要求支付拖欠的工资和可能的赔偿。
- 此外，这种做法还可能损害事业单位的声誉和公信力，影响其长期发展。
风险防范：
- 事业单位应建立健全的工资发放机制和风险防范体系，确保在资金困难时能够公平、公正地处理工资发放问题。
- 同时，应加强与员工的沟通和协商，共同应对资金困难，避免法律纠纷的发生。
建议：差额拨款的事业单位在发不出工资的情况下，应综合考虑法律法规、实际操作和法律后果等多个方面，确保公平、公正地处理工资发放问题。如果存在具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律意见。