因自己违规操作被公司停薪留职，这一行为是否违法，需分情况讨论：
公司规章制度合法且明确规定违规操作后果为停薪留职：
- 若公司的规章制度是依法制定的，且明确规定了员工违规操作的具体情形及相应的处罚措施，包括停薪留职，同时该规章制度已经过民主程序（如职工代表大会讨论）并公示给员工，那么公司依据此规章制度对员工进行停薪留职处理，在程序上可能是合法的。但需注意，停薪留职期间员工的权益保障，如社会保险的缴纳等，仍需公司依法履行。
公司规章制度未明确规定违规操作后果为停薪留职，或规章制度不合法：
- 若公司的规章制度未明确规定违规操作会导致停薪留职，或者规章制度本身存在违法情形（如未经过民主程序制定、未公示给员工等），那么公司擅自对员工进行停薪留职处理，则可能是违法的。在此情况下，员工有权要求公司恢复其工资待遇，并可能依据相关法律法规追究公司的法律责任。
停薪留职期间公司未履行基本义务：
- 无论公司规章制度如何规定，若在停薪留职期间，公司未依法为员工缴纳社会保险、未提供必要的劳动保护条件等，则公司的行为肯定是违法的。员工有权要求公司补缴社会保险、提供劳动保护条件，并可能因此解除劳动合同并要求公司支付经济补偿。
法律背景与建议：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。同时，用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
- 对于员工而言，若遭遇公司违法停薪留职的情况，建议首先与公司进行沟通协商，要求公司恢复工资待遇并履行相关义务。若协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
可能的法律后果：
- 若公司违法停薪留职，员工可能因此解除劳动合同，并要求公司支付经济补偿。同时，公司还可能面临劳动监察部门的处罚，包括罚款、责令改正等。
综上所述，因自己违规操作被公司停薪留职是否违法，需根据公司的规章制度是否合法、是否明确规定以及停薪留职期间公司是否履行基本义务等多方面因素进行综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。