结论前置：实习结束时，用人单位应当结清工资，这是劳动者的合法权益。
法律背景与解释：
实习关系的法律性质：
- 实习关系通常被视为一种劳务关系或民事法律关系，而非典型的劳动关系。但无论实习关系如何定性，实习生在提供劳务后，都有权获得相应的报酬，这是基于公平原则和等价有偿原则的基本要求。
工资结清的法律依据：
- 虽然具体的实习协议可能因单位而异，但根据《中华人民共和国民法典》中关于合同履行的原则，当事人应当按照约定全面履行自己的义务。实习协议中若约定了工资支付方式和时间，用人单位应按约定执行。
- 即便实习协议中没有明确约定工资结清的时间，从公平和诚信的角度出发，用人单位也应在实习结束时结清工资，以避免给实习生造成不必要的经济困扰。
实际操作中的建议：
- 实习前：在签订实习协议时，实习生应仔细阅读协议条款，特别是关于工资支付的部分，确保自己的权益得到明确保障。如果协议中没有明确约定工资结清的时间，可以与用人单位协商补充约定。
- 实习期间：实习生应保留好与工资支付相关的证据，如工资条、转账记录等，以备不时之需。
- 实习结束时：如果用人单位未按时结清工资，实习生可以首先与用人单位协商解决。如果协商无果，实习生可以向当地的劳动监察部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。
可能的法律后果：
- 如果用人单位未按时结清工资，除了需要支付拖欠的工资外，还可能面临劳动监察部门的处罚，如罚款、责令改正等。
- 在极端情况下，如果用人单位的行为构成恶意拖欠工资，还可能触犯《中华人民共和国刑法》中关于拒不支付劳动报酬罪的规定，面临更严重的法律后果。
进一步思考：
- 实习生在维护自己权益的同时，也应保持理性和克制，避免采取过激行为。通过合法途径解决问题，既是对自己权益的尊重，也是对社会秩序的维护。
- 用人单位也应增强法律意识，遵守相关法律法规，按时足额支付实习生工资，以树立良好的企业形象，吸引更多优秀人才。
总结：实习结束时，用人单位应当结清工资，这是实习生的合法权益。如果用人单位未按时结清工资，实习生可以通过协商、投诉或法律途径来维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。