结论前置：公务员在面对上级的违法命令时，不应服从，并应依法履行报告义务。以下从法律义务、法律后果及实际操作建议三个角度进行详细分析：

一、公务员的法律义务：拒绝违法命令与报告

根据《中华人民共和国公务员法》第六十条，公务员在执行公务时，若认为上级的决定或命令存在错误，有权提出改正或撤销的意见。若上级坚持原决定或命令，且该决定或命令明显违法，公务员有权拒绝执行，并需同时向上级机关报告。这一规定明确了公务员在面对违法命令时的法律义务，即拒绝执行并报告，而非盲目服从。

二、不服从违法命令的法律后果：免责与保护

1. 免责条款：若公务员因拒绝执行违法命令而遭受不公正对待，如被处分或追究责任，其有权依法进行申诉、控告或检举。法律为公务员提供了免责机制，确保其在拒绝违法命令时不会受到不当处罚。
2. 法律保护：公务员在履行拒绝违法命令的义务时，受到法律的保护。若因拒绝执行违法命令而遭受打击报复，公务员可依法维护自身权益，相关责任人将受到法律制裁。

三、实际操作建议：如何应对违法命令

1. 明确判断：公务员在接到上级命令时，应首先判断该命令是否合法。若存在疑问，可咨询法律专业人士或相关部门，确保判断的准确性。
2. 及时沟通：若认为命令违法，公务员应及时与上级沟通，提出改正或撤销的意见。在沟通过程中，应保持冷静、理性，以事实为依据，以法律为准绳。
3. 拒绝执行并报告：若上级坚持执行违法命令，公务员应坚决拒绝执行，并立即向上级机关报告。报告时应详细说明命令违法的事实、依据及自己的判断过程，以便上级机关及时采取措施。
4. 保留证据：在拒绝执行违法命令的过程中，公务员应保留相关证据，如命令文件、沟通记录等，以备不时之需。这些证据在后续申诉、控告或检举过程中将发挥重要作用。

举例说明：假设某公务员接到上级命令，要求其违规审批某项目。该公务员在判断命令违法后，首先与上级沟通，提出改正意见。若上级坚持执行，该公务员应拒绝执行，并立即向上级机关报告，同时保留相关证据。若因此遭受不公正对待，该公务员可依法进行申诉、控告或检举，维护自身权益。

总结与建议：公务员在面对上级的违法命令时，应坚守法律底线，拒绝执行并报告。这不仅是对自身权益的保护，也是对法律尊严的维护。若在实际操作中遇到困难或疑问，可直接向我咨询，我将提供专业的法律建议和支持。