劳务施工队长和安全员由项目发工资是否合法，需分情况讨论：

1. 若他们与项目方构成劳动关系：

   • 合法性分析：根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位（包括项目方）应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。若劳务施工队长和安全员与项目方签订了劳动合同，并建立了正式的劳动关系，那么项目方作为用人单位，有义务直接向他们支付工资。这种情况下，项目发工资是合法的。
   • 建议：确保劳动合同中明确约定了工资支付方式、时间和标准，以避免后续纠纷。

2. 若他们与项目方构成劳务关系：

   • 合法性分析：在劳务关系中，提供劳务的一方（如劳务施工队长和安全员）通常按照与接受劳务一方（如项目方）的约定完成工作，并获取相应的劳务报酬。若双方约定由项目方直接支付工资，且这种约定不违反法律法规的强制性规定，那么项目发工资也是合法的。但需要注意的是，劳务关系与劳动关系在法律保护、权益保障等方面存在差异。
   • 建议：在签订劳务合同时，应明确约定双方的权利义务，包括工资支付方式、时间和标准等，以确保自身权益得到保障。

3. 若存在违法分包或转包情况：

   • 合法性分析：如果项目方存在违法分包或转包行为，将工程分包给不具备相应资质的单位或个人，而劳务施工队长和安全员实际上是为这些不具备资质的单位或个人工作，那么项目方直接向他们支付工资可能涉及违法分包或转包的法律责任问题。在这种情况下，项目发工资的合法性可能受到质疑。
   • 建议：对于劳务施工队长和安全员而言，应谨慎选择工作单位，避免为不具备资质的单位或个人提供劳务。对于项目方而言，应严格遵守相关法律法规，避免违法分包或转包行为。

额外提醒：

• 无论是劳动关系还是劳务关系，双方都应签订书面合同，明确约定各自的权利义务，以避免后续纠纷。
• 若发生工资支付纠纷，双方应首先通过协商解决；协商不成的，可以向劳动争议调解委员会申请调解，或者依法向劳动争议仲裁机构申请仲裁；对仲裁裁决不服的，还可以向人民法院提起诉讼。

总结：劳务施工队长和安全员由项目发工资是否合法，取决于他们与项目方之间的法律关系以及相关法律法规的约定。在签订合同时，双方应明确约定工资支付方式、时间和标准等关键条款，以确保自身权益得到保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。