在公司与中介、业主签订的租房三方合同中，发票的开具责任通常取决于合同的具体约定以及相关法律法规的规定。以下从不同角度进行分析：

1. 合同约定优先：

   • 在租房三方合同中，各方可以明确约定发票的开具方。如果合同中明确规定了由业主或中介开具发票，那么就应当按照合同约定执行。这种约定是各方真实意思的表示，具有法律效力。
   • 示例：若合同中明确写明“业主应向承租方（公司）开具合法有效的租金发票”，则业主有义务开具发票。

2. 法律法规规定：

   • 根据《中华人民共和国发票管理办法》的相关规定，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，收款方应当向付款方开具发票。在租房场景中，业主作为出租方，收取租金，通常应当向承租方（公司）开具发票。
   • 特殊情况：如果中介在合同中承担了代收租金等特定职责，并且合同中明确约定了由中介开具发票，那么中介也可能成为发票的开具方。但这种情况需要合同中有明确的约定，并且中介需要具备开具发票的合法资质。

3. 实际操作建议：

   • 明确合同条款：在签订租房三方合同时，各方应当明确约定发票的开具方、发票类型、开具时间等关键条款，以避免后续纠纷。
   • 沟通协商：如果合同中没有明确约定发票的开具方，或者约定不明确，各方应当通过沟通协商的方式确定发票的开具责任。在协商过程中，可以参考相关法律法规的规定以及行业惯例。
   • 保留证据：无论发票由谁开具，各方都应当保留好相关证据，如合同、付款凭证、发票等，以备不时之需。

可能涉及的法律后果：

• 如果应当开具发票的一方未按照约定或法律法规的规定开具发票，可能面临税务机关的处罚，包括罚款等。
• 对于承租方（公司）而言，如果未取得合法有效的发票，可能无法进行正常的财务报销和税务抵扣，从而造成经济损失。

总结与建议：

• 在签订租房三方合同时，务必明确发票的开具责任，并在合同中详细约定相关条款。
• 如果合同中没有明确约定或约定不明确，各方应当通过沟通协商的方式确定发票的开具责任，并确保符合相关法律法规的规定。
• 如有任何疑问或纠纷，建议及时咨询专业律师，以维护自身合法权益。

希望以上分析能对您有所帮助。如果您在房产租赁、合同纠纷或金融保险等领域有任何法律问题，欢迎直接向我咨询。