核心结论：公司因自身制度不完善而一直扣工资，属于违法行为，劳动者可通过多种途径维权。以下是具体分析：

1. 公司扣工资的合法性分析
   根据《工资支付暂行规定》第十五条，用人单位不得克扣劳动者工资，除非存在法定扣减情形（如代扣代缴个人所得税、社保费、法院判决的抚养费等）。若公司以“制度不完善”为由扣工资，且该制度未通过民主程序制定（如未与工会或职工代表协商）、未公示或违反法律法规，则属于违法克扣工资。

2. 维权途径

   • 与公司协商：首先可与公司人力资源部门或上级沟通，要求说明扣款依据，并出示合法有效的规章制度。若公司无法提供，可要求补发工资。
     
   • 向劳动监察部门投诉：若协商无果，可向当地劳动保障监察大队举报（拨打12333或通过当地人社局官网），提交劳动合同、工资条、扣款通知等证据，要求查处违法行为。
     
   • 申请劳动仲裁：若投诉未解决，可在1年内向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，主张公司支付被扣工资及可能的赔偿金（如克扣工资导致解除劳动合同的，可主张经济补偿）。
     

3. 注意事项

   • 证据收集：保留工资条、银行流水、扣款通知、公司制度文件（如有）、沟通记录等证据，证明公司存在违法扣款行为。
     
   • 时效性：劳动仲裁时效为1年，自知道或应当知道权利被侵害之日起计算，需及时行动。
     
   • 避免自行离职：若以公司违法扣款为由解除劳动合同，需通过书面形式通知公司并说明理由，否则可能影响经济补偿主张。
     

建议：优先通过协商或投诉解决，若公司态度强硬，可果断申请仲裁。如需进一步指导，可直接向我提供具体细节（如扣款金额、公司制度内容等），我将为你定制维权方案。