甲方在施工方不配合对账的情况下，一般是可以起诉施工方的，但需结合具体情况分析。以下从不同角度为您详细分析：
一、从合同义务角度分析
在建设工程合同中，双方通常会约定对账的义务和流程。如果合同中明确规定了施工方有配合对账的义务，而施工方拒绝履行，那么甲方有权依据合同条款，要求施工方承担违约责任。在此情况下，甲方起诉施工方要求其履行对账义务或赔偿因不配合对账造成的损失，是有合同依据的。
二、从法律救济途径角度分析
起诉要求履行合同义务：如果合同中有明确约定，甲方可以起诉施工方，要求其按照合同约定履行对账义务。法院在审理此类案件时，会依据合同条款和实际情况，判断施工方是否构成违约，并作出相应的判决。
起诉要求赔偿损失：如果施工方的不配合行为导致甲方产生了实际损失（如因无法及时对账而导致的资金占用成本、管理成本增加等），甲方可以起诉施工方要求赔偿这些损失。在此情况下，甲方需要提供充分的证据证明损失的存在和金额，以及损失与施工方不配合行为之间的因果关系。
三、从实际操作角度分析
收集证据：在起诉前，甲方需要收集充分的证据证明施工方不配合对账的事实，以及因此造成的损失。这些证据可能包括合同文本、往来函件、邮件、短信记录、现场照片或视频等。
选择管辖法院：根据合同约定或法律规定，选择适当的管辖法院进行起诉。一般来说，建设工程合同纠纷由工程所在地法院管辖，但双方也可能在合同中约定其他管辖法院。
准备起诉材料：包括起诉状、证据清单、授权委托书等。起诉状应明确列明原告、被告的基本信息、诉讼请求、事实和理由等。
四、注意事项
尽量协商解决：在起诉前，甲方可以尝试与施工方进行协商，寻求和解或调解的可能性。这有助于节省诉讼成本和时间，同时维护双方的良好合作关系。
注意诉讼时效：根据法律规定，民事权利受到侵害后，权利人应在一定期限内提起诉讼。否则，将可能丧失胜诉权。因此，甲方在发现施工方不配合对账后，应及时采取行动，避免超过诉讼时效。
建议：如果甲方决定起诉施工方，建议提前咨询专业律师（比如我），以确保起诉材料的准备和诉讼策略的制定符合法律规定和实际情况。同时，在诉讼过程中，甲方应积极配合法院的审理工作，提供充分的证据和理由支持自己的诉讼请求。如果您有进一步的法律问题或需要具体的法律建议，可以直接向我咨询。