结论前置：

1. 若因夜班身体不适请假，公司不得以此为由克扣工资。
2. 若公司存在违法行为，可通过协商、投诉或劳动仲裁维权。

核心前提与法律分析： 根据《劳动法》及《劳动合同法》相关规定，劳动者因身体原因请假属于合法事由，公司不得以“请假”为由拒绝支付工资。具体分析如下：

一、公司不得克扣工资的法律依据

1. 病假工资支付义务
   根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，劳动者在医疗期内（即因病或非因工负伤停止工作治病休息期间），公司需按不低于当地最低工资标准的80%支付病假工资。若您因夜班身体不适请假且符合医疗期条件，公司无权扣发工资。

2. 事假工资的合理性
   若您请的是事假（如未提供医院证明），公司可酌情扣发当日工资，但需符合以下条件：

   • 扣发金额不得超过当日应发工资；
     
   • 扣发规则需在劳动合同或规章制度中明确约定，且不违反法律强制性规定。

二、公司违法行为的维权路径

1. 协商解决
   首先与公司沟通，明确要求按法律规定支付工资，并保留书面沟通记录（如邮件、微信聊天记录）。

2. 投诉举报
   若协商无果，可向当地劳动监察大队投诉（拨打12333热线或通过“全国根治欠薪线索反映平台”提交线索），要求劳动部门介入调查并责令公司改正。

3. 劳动仲裁
   若投诉未果，可在劳动关系终止之日起1年内申请劳动仲裁，主张以下权益：

   • 补发被克扣的工资；
     
   • 若公司未缴纳社保或未签订劳动合同，可一并主张经济补偿金或双倍工资差额。

三、关键证据收集建议

为提高维权成功率，需提前准备以下证据：

1. 劳动关系证明：劳动合同、工资条、社保缴纳记录等；
   
2. 请假事实证明：请假条、医院诊断证明、同事证言等；
   
3. 公司违法证据：工资条、银行流水（显示工资被扣）、公司规章制度（若存在违法条款）等。

温馨提示：若公司以“旷工”为由解除劳动合同，需核实公司是否履行了通知义务（如发送返岗通知）。若未履行，可能构成违法解除，您可主张赔偿金（2N倍月工资）。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作步骤。