入职两年后单位才签订劳动合同，员工一般不能再主张未签劳动合同的二倍工资，但可以要求用人单位补签书面劳动合同以明确双方权利义务。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与双倍工资支付规定
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定：
- 用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。这一规定旨在保护劳动者的合法权益，督促用人单位及时与劳动者签订书面劳动合同。
- 用人单位自用工之日起满一年不与劳动者订立书面劳动合同的，视为用人单位与劳动者已订立无固定期限劳动合同。这意味着，超过一年未签订书面劳动合同，法律上已视为双方订立了无固定期限劳动合同，劳动者再主张双倍工资将缺乏法律依据。
二、双倍工资支付期限与仲裁时效
- 支付期限：双倍工资的支付期限最长为11个月，即从用工之日起的第二个月到第十二个月。超过一年后，由于已视为订立无固定期限劳动合同，劳动者无法再要求双倍工资。
- 仲裁时效：对于双倍工资的仲裁请求，其时效一般为一年，从用人单位不签订书面劳动合同的违法行为结束之次日开始计算。因此，在工作已满两年的情况下，劳动者提出双倍工资的主张很可能已超过仲裁时效，从而无法得到法律支持。
三、特殊情况下的考量
尽管一般情况下工作两年未签劳动合同不能主张双倍工资，但如果存在特殊情况，如不可抗力或劳动者曾向用人单位主张过权益等导致仲裁时效中断的情形，劳动者仍有可能争取到部分双倍工资。不过，这需要根据实际情况及相关证据来综合判断，且成功主张的可能性相对较小。
四、劳动者的其他权益保护
虽然不能主张双倍工资，但劳动者仍有权要求用人单位补签书面劳动合同，以明确双方的权利和义务。若用人单位拒绝补签，劳动者可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径来维护自身的合法权益。这包括但不限于要求确认劳动关系、追讨欠薪、要求经济补偿等。
五、建议与注意事项
- 及时维权：劳动者应关注自己的权益，一旦发现用人单位未依法签订书面劳动合同，应及时通过法律途径维护自己的合法权益，避免超过仲裁时效。
- 保留证据：劳动者应保留好与用人单位存在劳动关系的证据，如工作证、考勤记录、工资条等，以便在需要时提供证明。
- 了解当地政策：不同地区的司法实践可能存在差异，劳动者应了解当地的政策和法规，以便更好地维护自己的权益。
总结来说，入职两年后单位才签订劳动合同，员工一般不能再主张未签劳动合同的二倍工资。但劳动者仍应积极采取措施保护自己的合法权益，如要求补签劳动合同、通过法律途径维权等。如果你在此过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。