结论：公司因您发烧请假而按事假扣除工资，这一做法在大多数情况下是违法的。
一、法律背景与规定
根据我国《劳动法》及相关规定，职工在患病或非因工负伤需要停止工作医疗时，用人单位应当根据职工实际工作年限和在本单位工作年限，给予一定的医疗期，并在医疗期内支付病假工资或疾病救济费。具体来说：
- 医疗期：医疗期的长度根据职工实际工作年限和在本单位工作年限确定，一般为三个月到二十四个月不等。
- 病假工资：在医疗期内，用人单位应当按照不低于当地最低工资标准的80%支付职工病假工资。如果劳动合同或集体合同中有更高标准的约定，则按照约定执行。
二、公司行为的合法性分析
若您已按规定办理请假手续：
- 在这种情况下，公司应当按照法律规定支付您病假工资，而不是按事假扣除工资。公司扣除工资的行为涉嫌违法。
若您未按规定办理请假手续：
- 如果您未按照公司规定办理请假手续，公司可能将您的行为视为旷工。然而，即使如此，公司也不得任意全额扣减您的工资。公司应当根据实际情况，如您是否提供了合理的解释或证明（如医疗证明），以及公司规章制度的具体规定，来决定是否扣除工资及扣除的金额。
公司规章制度的影响：
- 如果公司有明确的、具有法律效力的规章制度，规定发烧请假将被扣除部分工资，并且这项制度已经通过民主程序制定并向员工公开通告，那么在某些情况下，公司可能按照规章制度执行而不被视为违法。但这种情况较为特殊，且规章制度的内容必须合法、合理。
三、您的权益与应对措施
与公司协商：
- 首先，您可以尝试与公司进行协商，说明您的情况和法律依据，要求公司按照法律规定支付病假工资。
向劳动监察部门投诉：
- 如果协商无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉，请求他们介入调查并处理公司的违法行为。
提起劳动仲裁：
- 如果投诉仍未解决问题，您可以向劳动仲裁委员会提起劳动仲裁，要求公司支付应得的病假工资及可能的赔偿。
四、建议与注意事项
保留证据：
- 在处理此类纠纷时，务必保留好相关证据，如医疗证明、请假记录、工资条等，以便在需要时证明自己的权益。
了解公司规章制度：
- 在入职或工作时，应仔细了解公司的规章制度，特别是关于请假和工资支付的规定，以便在发生纠纷时能够准确判断公司的行为是否合法。
及时咨询专业律师：
- 虽然我在这里为您提供了一些法律分析和建议，但每个案件的具体情况都有所不同。因此，在处理此类纠纷时，及时咨询专业律师是非常重要的。不过，您现在就可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。
综上所述，公司因您发烧请假而按事假扣除工资的行为在大多数情况下是违法的。您有权要求公司按照法律规定支付病假工资，并在必要时采取法律措施维护自己的权益。