针对您提出的“提交了辞职通知书领导让提交离职申请怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确辞职通知书与离职申请在法律和实际操作中的区别。辞职通知书通常是员工单方面向公司表达离职意愿的书面文件，它明确了员工的离职日期和原因，并具有一定的法律效力。而离职申请则可能更多地被视为一种公司内部的流程文件，用于记录员工的离职意向并经过公司相关部门的审批。

一、分析当前情况

1. 已提交辞职通知书：您已经按照正规流程提交了辞职通知书，这表明您已经明确表达了离职的意愿，并给出了离职的日期。

2. 领导要求提交离职申请：领导可能出于公司内部流程管理的需要，希望您再提交一份离职申请。这并不意味着您的辞职通知书无效，而是公司可能希望有一个更完整的离职记录流程。

二、应对策略

1. 与领导沟通：

   • 首先，您可以与领导进行沟通，了解公司提交离职申请的具体要求和目的。
   • 询问是否可以将您已提交的辞职通知书作为离职申请的一部分，或者是否需要单独填写一份离职申请表。

2. 根据公司要求操作：

   • 如果公司有明确的离职申请流程，并且要求您单独提交离职申请，那么建议您按照公司要求操作。
   • 在填写离职申请时，确保信息准确无误，并与您之前提交的辞职通知书内容保持一致。

3. 保留证据：

   • 无论您选择哪种方式，都建议您保留好相关证据，如辞职通知书的复印件、离职申请的提交记录等。
   • 这些证据在后续可能出现的纠纷中，将作为您证明自己已按照正规流程提出离职的重要依据。

三、注意事项

1. 保持专业态度：在离职期间，继续保持专业和积极的工作态度，完成交接工作，并尽量减少对团队的影响。

2. 关注离职手续：确保您按照公司规定办理了所有离职手续，如工作交接、公司财物归还、离职证明签署等。

3. 了解后续事项：如果您计划在其他城市工作，及时了解社保转移的相关规定，并及时办理转移手续。同时，如果离职后可能接触到公司的商业秘密或掌握重要客户资源，应签署保密协议或竞业禁止协议。

综上所述，当您已经提交了辞职通知书而领导要求提交离职申请时，建议您与领导进行沟通，了解公司具体要求，并按照公司流程操作。同时，保留好相关证据，确保自己的权益得到保障。希望这些建议能对您有所帮助。