结论前置：
- 公司规定不能外出，但员工因生理需求外出上厕所被扣钱，这一做法通常是不合法的。
- 员工有权要求公司撤销扣款决定，并可通过法律途径维护自身权益。
详细分析：
首先，我们需要明确的是，员工的基本生理需求，如上厕所，是受到法律保护的。公司不能以任何理由，包括所谓的“公司规定”，来剥夺或限制员工的这一基本权利。
从劳动法的角度来看：
- 根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，劳动者享有获得劳动安全卫生保护的权利。这包括提供符合国家规定的劳动安全卫生条件和必要的劳动防护用品，以及保障劳动者在劳动过程中的安全与健康。虽然直接的法律条文可能并未明确提及“上厕所”这一具体行为，但保障劳动者的基本生理需求无疑是劳动安全卫生保护的一部分。
- 公司规定不能外出，这一规定本身可能就存在不合理性。如果这一规定限制了员工的基本生理需求，那么该规定很可能被视为违法或无效。
从公司规章制度的角度来看：
- 公司的规章制度应当合法、合理，并且不得与国家的法律法规相抵触。如果公司的规章制度违反了法律法规，或者侵犯了员工的合法权益，那么该规章制度将被视为无效。
- 在本案中，公司因员工外出上厕所而扣款，这一做法很可能违反了公司的规章制度应当合法、合理的原则。因为上厕所是员工的正常生理需求，公司不能以此为由进行扣款。
从员工权益保护的角度来看：
- 员工有权要求公司撤销不合理的扣款决定。如果公司拒绝撤销，员工可以通过法律途径来维护自己的权益，如向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或者向人民法院提起诉讼。
- 在此过程中，员工需要保留好相关证据，如公司的扣款通知、工资条等，以便在仲裁或诉讼过程中证明自己的权益受到了侵害。
建议与行动：
- 员工可以先与公司进行沟通，要求公司撤销扣款决定，并说明自己的理由和依据。
- 如果公司拒绝撤销扣款决定，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，或者向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 在整个过程中，员工应当保持冷静和理性，通过合法途径来维护自己的权益。
最后需要强调的是，员工的基本生理需求是受到法律保护的，公司不能以任何理由来剥夺或限制这一权利。如果员工遇到了类似的问题，应当勇敢地站出来维护自己的权益。如果有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。