结论：企业是否可以给老板报销其自掏腰包发放给农民工的工资，需视具体情况而定，包括但不限于劳动合同、工资支付规定、企业内部规章制度以及相关法律法规的遵循情况。

一、从劳动合同与工资支付规定角度分析

1. 劳动合同约定：

   • 如果老板（或企业法定代表人、负责人）与农民工之间存在劳动合同，且合同中明确规定了工资支付的方式、时间和金额，那么老板自掏腰包发放工资可能并不符合合同约定。在此情况下，企业若要报销这部分费用，需确保报销行为不违反劳动合同的相关条款。

2. 工资支付规定：

   • 根据《劳动法》及相关规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠。如果老板自掏腰包发放工资是因为企业工程款未到位，而这一行为并未违反工资支付的相关规定（如未拖欠工资、未低于最低工资标准等），那么企业报销这部分费用在法律上可能并无直接障碍。但需注意，报销行为应基于真实、合法的支出，且不得损害农民工的合法权益。

二、从企业内部规章制度角度分析

1. 报销政策：

   • 企业内部可能存在关于费用报销的规章制度，明确规定了哪些费用可以报销、报销的流程和条件等。如果老板自掏腰包发放工资的行为符合企业内部的报销政策，且报销流程合规，那么企业可以给予报销。

2. 财务合规性：

   • 企业报销费用需确保财务合规性，包括但不限于发票的真实性、费用的合理性以及与业务的相关性等。如果老板自掏腰包发放工资的费用无法提供合规的发票或证明文件，或者费用与业务无直接关联，那么企业可能无法给予报销。

三、从相关法律法规角度分析

1. 税务法规：

   • 老板自掏腰包发放工资可能涉及税务问题，如个人所得税的代扣代缴等。如果报销行为导致税务上的不合规（如未代扣代缴个人所得税），那么企业可能面临税务风险。因此，在报销前，企业应确保税务上的合规性。

2. 劳动保障法规：

   • 根据《劳动保障监察条例》等相关规定，用人单位不得克扣或者无故拖欠劳动者工资。如果老板自掏腰包发放工资是为了避免拖欠工资而采取的临时措施，且这一行为并未违反劳动保障法规的其他规定，那么企业报销这部分费用在法律上可能并无直接问题。但需注意，报销行为应确保不损害农民工的合法权益，且应尽快通过正常渠道支付工资。

四、建议与注意事项

1. 完善内部制度：

   • 企业应完善内部关于费用报销的规章制度，明确报销的范围、条件和流程等，以确保报销行为的合规性。

2. 确保税务合规：

   • 在报销前，企业应确保税务上的合规性，包括代扣代缴个人所得税等。

3. 保护农民工权益：

   • 无论是否报销，企业都应确保农民工的合法权益不受损害，包括按时足额支付工资等。

4. 咨询专业意见：

   • 如果企业对报销行为存在疑虑或不确定，建议咨询专业律师或税务师的意见，以确保行为的合法性和合规性。

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