核心结论：针对承包方已结清包工头工程款但工人仍索要工资的情况，需分步骤核实法律关系、固定证据、通过协商或法律途径解决，具体处理方式如下：

一、核实法律关系与责任主体

1. 承包方与包工头的法律关系
   若承包方与包工头为工程分包关系（包工头不具备用工主体资格），根据《保障农民工工资支付条例》第三十条，承包方需对工人工资承担先行清偿责任，即使已结清工程款，仍可能因包工头未支付工资而被追责。
   例外情形：若承包方能证明已将工资直接发放至工人（如通过银行代发、工人签字确认等），可免除责任。

2. 工人与包工头的法律关系
   工人与包工头通常构成劳务关系，工资支付义务主体为包工头。若包工头未支付工资，工人可依据《民法典》第五百七十九条要求其履行支付义务。

二、固定关键证据

1. 承包方需留存的证据

   • 与包工头的工程款结算协议（明确已结清款项）；
     
   • 工资支付凭证（如银行转账记录、工人签字收据）；
     
   • 包工头出具的工资支付承诺书（若有）。

2. 工人需留存的证据

   • 劳务合同（如有）、工作记录（如考勤表、工单）；
     
   • 包工头未支付工资的书面证明（如欠条、聊天记录）；
     
   • 承包方与包工头的分包合同（证明承包方为总包方）。

三、分情况处理纠纷

1. 若承包方未直接支付工资

   • 协商解决：承包方、包工头、工人三方共同核对工作量及工资数额，由承包方从剩余工程款（如有）中直接支付工人，或与包工头约定分期支付。
     
   • 行政投诉：工人可向当地劳动监察大队投诉，要求承包方先行清偿工资（依据《保障农民工工资支付条例》第三十条）。
     
   • 诉讼途径：承包方承担先行清偿责任后，可向包工头追偿；工人也可直接起诉包工头要求支付工资。

2. 若承包方已直接支付工资

   • 提供证据抗辩：承包方需向工人或劳动部门出示工资支付凭证，证明已履行义务。
     
   • 追究包工头责任：若包工头虚构工资数额或冒领工资，承包方可报警或起诉其涉嫌诈骗或侵占罪。

四、预防性建议

1. 承包方：

   • 避免将工程分包给无资质的包工头；
     
   • 签订分包合同时明确工资支付条款（如要求包工头提供工人工资表、授权承包方代发工资）；
     
   • 定期监督包工头工资发放情况。

2. 工人：

   • 要求包工头出具书面工资欠条；
     
   • 优先选择与承包方直接签订劳务合同（若可能）；
     
   • 及时向劳动部门备案务工信息。

提示：此类纠纷涉及劳动法、合同法及行政法规交叉适用，建议根据具体证据类型选择最优解决路径。如有进一步疑问，可直接向我提供合同、凭证等材料，我将协助分析责任主体及维权策略。