针对您提出的“在厂上班跟上司吵架被罚款合法吗”这一问题，我们需要从多个角度来进行分析。

首先，从一般原则出发，用人单位通常无权直接对员工进行罚款。罚款作为一种行政处罚措施，其执行主体应为行政机关，而非企业。因此，如果工厂仅凭员工与上司吵架这一行为就进行罚款，且没有明确的规章制度作为依据，那么这种罚款行为很可能是不合法的。

然而，我们也需要考虑到企业规章制度的因素。如果企业的规章制度中明确规定了员工在工作场所应保持文明礼貌，禁止吵架斗殴，并设定了相应的处罚措施（包括罚款），且这些规章制度经过了民主程序制定（如员工代表大会讨论通过），并向劳动者进行了公示告知，那么在这种情况下，员工因吵架行为违反规定而受到罚款，可能会被认定为具有合理性。

但即便如此，罚款的金额也必须合理适度，不能过高以至于损害员工的合法权益。如果罚款金额过高，或者罚款行为缺乏明确的规章制度依据，员工有权拒绝接受罚款，并可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

综上所述，在厂上班跟上司吵架被罚款是否合法，关键在于企业规章制度的有效性以及罚款行为的合理性与适度性。如果工厂没有明确的规章制度作为依据，或者罚款行为不合理、不适度，那么员工有权拒绝接受罚款，并寻求法律途径来维护自己的权益。