公司迟到5分钟扣10元是否合法，需分情况讨论：

1. 若公司规章制度合法且合理：

   • 合法性前提：公司有权根据运营情况制定劳动规章制度，包括迟到处理办法。但这一权利必须在法律框架内行使，且规章制度需经过民主程序制定（如职工代表大会讨论、与工会或职工代表平等协商），并向劳动者公示或告知。
   • 合理性要求：扣除的金额需合理，不得违反《工资支付暂行规定》中关于工资扣除的限制。例如，若因迟到给公司造成直接经济损失，且公司能提供充分证据，可要求赔偿，但每月扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
   • 结论：在此情况下，公司迟到5分钟扣10元，若规章制度合法、合理且已公示告知，可视为合法。

2. 若公司规章制度不合法或不合理：

   • 不合法情形：规章制度未经民主程序制定、未公示或告知劳动者，或扣除金额违反法律规定（如超过工资扣除限制）。
   • 不合理情形：扣除金额过高，与迟到行为的轻微性质不成比例，或未考虑劳动者的实际困难。
   • 结论：在此情况下，公司迟到5分钟扣10元，可能因规章制度不合法或不合理而被视为违法。

法律建议：

• 员工角度：若认为公司迟到罚款制度不合理或违法，可先与公司沟通要求纠正。若沟通无果，可向劳动行政部门投诉或举报，或申请劳动仲裁维护自身权益。
• 公司角度：制定规章制度时，应确保合法、合理且公正，并经过民主程序制定、公示告知。执行过程中，应确保扣除金额合理，不得违反法律规定。

可能法律后果：

• 若公司规章制度不合法或不合理，可能面临劳动行政部门的处罚，或需向劳动者支付赔偿金。
• 若员工因公司违法行为而申请劳动仲裁，公司可能需承担仲裁费用及赔偿劳动者因此遭受的损失。

总结：公司迟到5分钟扣10元是否合法，取决于公司规章制度的合法性、合理性及公示告知情况。若有问题，可直接向我咨询，我将提供专业的法律意见。