当您的确认劳动关系申请被驳回，进而导致工伤认定受阻时，您可以按照以下步骤来妥善处理这一问题，以有效维护自己的合法权益：

一、明确驳回原因并理解法律后果

首先，您需要仔细查阅工伤认定部门或劳动仲裁机构出具的驳回决定书，明确驳回的具体理由。这通常可能包括申请材料不齐全、劳动关系证明不足、超过申请时效或受伤情况不符合工伤认定标准等。理解驳回原因是后续行动的基础，它能帮助您确定下一步应该采取的措施。

二、针对驳回原因采取相应措施

1. 补充材料并重新申请：

   • 如果驳回是因为申请材料不齐全或劳动关系证明不足，您需要按照要求补充完善相关材料，如劳动合同、工资发放记录、工作证、同事证言等，以证明您与用人单位之间存在劳动关系。
   • 准备好完整材料后，在规定的时间内（通常是收到驳回决定书后的一定期限内）向原工伤认定部门或劳动仲裁机构重新提交申请。

2. 申请行政复议：

   • 如果您对驳回决定有异议，认为驳回理由不充分或存在错误，您可以在收到驳回决定书之日起60日内向上一级劳动保障行政部门或同级人民政府提出行政复议申请。
   • 提交复议申请书时，应详细说明驳回决定的不合理性，并提供相关证据材料支持您的观点。

3. 提起行政诉讼：

   • 如果您对行政复议结果仍不满意，或者选择不经过行政复议程序，您可以在收到驳回决定书之日起6个月内直接向有管辖权的法院提起行政诉讼。
   • 提交起诉状时，应附上相关证据材料，并参与庭审过程，由法院对工伤认定驳回决定的合法性进行审查并作出判决。

三、寻求专业法律支持

在整个处理过程中，咨询专业的劳动法律师是非常重要的。律师能够根据您的具体情况提供个性化的法律分析和应对策略，协助您收集证据、准备法律文书，并在行政复议或行政诉讼中提供专业代理服务。这有助于最大程度地保障您的合法权益，提高维权成功率。

四、与用人单位协商解决

除了法律途径外，您还可以尝试与用人单位进行协商，探讨是否能够通过和解、补偿等方式解决纠纷。这有时能够作为一种更为高效、和谐的解决方案，避免长时间的法律程序和可能的诉讼风险。

五、注意事项与心态调整

• 证据收集：在整个处理过程中，务必确保提供的证据真实、有效，能够充分支持您的诉求。这包括劳动关系证明、医疗诊断证明、事故现场证人证言等。
• 遵循程序：严格按照法律规定的时间和程序要求进行操作，避免因程序错误而影响维权效果。
• 心态调整：保持冷静、理性的态度，积极面对并解决问题。维权过程可能漫长且复杂，但坚持下去往往能够取得满意的结果。

总之，当确认劳动关系被驳回导致工伤认定受阻时，您应通过多种途径积极争取自己的权益。同时，也建议您在日常工作中注意保存相关证据，以备不时之需。通过综合运用法律手段和专业支持，您有望成功维护自己的合法权益。