正在审理案件的材料补充阶段，被告不可以直接撤诉，但原告可以申请撤诉，且是否准许由法院裁定。以下是对此问题的详细分析：

一、撤诉的主体与时机

1. 撤诉主体：在诉讼过程中，有权申请撤诉的是原告，而非被告。被告在诉讼中主要承担答辩和举证的责任，无权主动申请撤诉。
2. 撤诉时机：原告可以在法院受理案件后至判决宣告前的任何阶段申请撤诉。这包括案件正在进行材料补充的阶段。

二、撤诉的申请与审查

1. 申请方式：原告可以通过书面或口头形式向法院提交撤诉申请。书面申请应明确表达撤诉的意愿和理由；口头申请则应在法院记录下相关内容并由原告签字确认。
2. 法院审查：法院在收到原告的撤诉申请后，会进行审查。审查的内容主要包括撤诉是否出于原告的真实意愿、撤诉是否损害国家利益、社会公共利益或他人合法权益等。

三、撤诉的后果与限制

1. 撤诉后果：一旦法院裁定准许撤诉，案件将终止审理。原告可以在法定时间内再次起诉，但需满足起诉条件。
2. 撤诉限制：
   • 特定案件限制：涉及国家利益、社会公共利益或他人合法权益的案件，可能需经过特定审批程序才可撤诉。例如，环境污染案件、消费者权益保护案件等。
   • 重复起诉限制：在某些情况下，撤诉后原告再次起诉可能受到限制。如离婚案件中，原告撤诉或者按撤诉处理后，没有新情况、新理由，六个月内又起诉的，法院可能不予受理。

四、针对被告的建议

虽然被告不能直接申请撤诉，但可以通过以下方式影响诉讼进程：

1. 与原告协商：被告可以尝试与原告进行协商，看是否能达成和解或原告自愿撤诉。
2. 积极应诉：被告应积极准备应诉材料，参与诉讼过程，以维护自己的合法权益。如果认为原告的诉讼请求无理或证据不足，可以在法庭上提出抗辩。

五、实际案例参考

在实际司法实践中，原告在材料补充阶段申请撤诉并获得法院准许的情况并不罕见。例如，在一起合同纠纷案件中，原告在提交了部分证据材料后，因与对方达成和解而申请撤诉。法院在审查后认为撤诉出于原告真实意愿且不损害他人利益，遂裁定准许撤诉。