签订劳动合同的单位和发工资的单位不一致，确实可能对员工产生影响，但具体影响需根据实际情况判断。以下从多个角度为你详细分析：
一、可能的原因及合法性分析
劳务派遣：
- 在劳务派遣关系中，劳动者与劳务派遣公司签订劳动合同，但实际工作地点和工作内容由用工单位安排。此时，工资可能由用工单位直接发放，或者通过劳务派遣公司转发。
- 合法性：这种情况通常符合法律法规的规定，但需确保劳务派遣协议完善，明确各方权责。
借调或外派：
- 员工可能被原用人单位借调到其他单位工作，或者因业务需要被外派到子公司、分公司或其他关联企业。在这种情况下，员工的劳动关系仍保留在原用人单位，但工资可能由实际工作的单位发放。
- 合法性：这种安排也是合法的，但需确保原用人单位与实际工作单位之间的协议明确，且员工的权益不受损害。
代发工资：
- 有些公司为了简化财务流程或出于其他考虑，会委托第三方机构（如人力资源服务公司）代为发放工资。
- 合法性：这种安排同样合法，但需确保代发工资的单位与签订劳动合同的单位之间存在合法的委托关系，且劳动者的权益不受影响。
违法分包或挂靠：
- 一些不具备合法经营资格的单位或个人可能会借用其他单位的名义进行经营活动，并招聘员工。这种情况下，劳动者可能与被挂靠的单位签订劳动合同，但实际工作和工资发放却由挂靠人或其他单位负责。
- 合法性：这种行为是违法的，劳动者的权益可能受到侵害。
二、可能产生的法律风险与影响
劳动关系认定困难：
- 如果发生劳动争议，如拖欠工资、工伤赔偿等，由于合同主体与实际用工主体不一致，可能导致劳动关系认定困难，增加维权难度。
社保缴纳问题：
- 如果发工资的单位未为劳动者缴纳社保，而劳动者又无法证明其与该单位存在劳动关系，可能导致社保权益受损。
税务风险：
- 对于个人所得税的申报和缴纳，也可能因为工资发放单位与合同签订单位不一致而产生问题。
三、应对措施与建议
核实情况：
- 劳动者应首先核实自己的劳动关系、工资发放情况以及社保缴纳情况，确保自己的权益不受损害。
保留证据：
- 妥善保管好劳动合同、工资条、银行流水等相关证据，以备不时之需。这些证据在维权时将起到关键作用。
与单位沟通：
- 如果发现问题，应及时与用人单位或发工资的单位进行沟通，要求解释原因并纠正不当行为。沟通时最好采用书面形式，以便留下证据。
寻求法律援助：
- 如果沟通无果或权益受到严重侵害，可以寻求劳动仲裁委员会或法院的帮助，维护自己的合法权益。在此过程中，律师的协助将大大提高维权效率。
举例说明：假设你与A公司签订了劳动合同，但工资却由B公司发放。如果A公司与B公司之间存在合法的关联关系（如关联企业或委托代发等），且你的劳动关系、工资发放和社保缴纳等权益均未受到损害，那么这种情况通常是合法的。然而，如果A公司与B公司之间不存在合法关联，或者你的权益受到了损害（如拖欠工资、未缴纳社保等），那么你就需要采取上述应对措施来维护自己的权益。
总结来说，签订劳动合同的单位和发工资的单位不一致并不一定无效，但可能带来一定的法律风险。因此，在签订合同前，劳动者应充分了解相关情况，避免潜在风险。如果遇到问题，应及时采取措施维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。