针对员工不办健康证的情况，作为管理者或负责人，您应当采取一系列正式且合规的措施来警告并纠正这一行为。以下是一个清晰、详细且有深度的处理流程：

一、明确法规要求

首先，您需要确保自己和员工都清楚了解相关的法律法规要求。根据《公共场所卫生管理条例》第七条和《公共场所卫生管理条例实施细则》第十条，公共场所直接为顾客服务的人员必须持有“健康合格证”方能从事本职工作。这是法律规定的义务，违反者将受到相应的行政处罚。

二、与员工进行正式沟通

1. 安排面谈：与未办理健康证的员工进行一对一的面谈，明确指出其未遵守法规的行为，并强调健康证对于保障顾客健康和安全的重要性。

2. 说明后果：向员工详细解释未办理健康证可能带来的法律后果，包括警告、罚款、停业整顿甚至吊销卫生许可证等。同时，也可以提及公司因此可能面临的声誉损失和业务影响。

3. 设定期限：给员工设定一个合理的期限，要求其在该期限内办理好健康证，并提交给公司备案。

三、发出书面警告

如果员工在面谈后仍未采取行动办理健康证，您应当向其发出书面警告。警告信应包含以下内容：

• 员工信息：包括姓名、职位、部门等。
• 违规事实：明确指出员工未办理健康证的行为。
• 法规依据：引用相关的法律法规条款，说明员工的行为违反了哪些规定。
• 处理决定：根据公司的规章制度和法律法规，决定对员工进行警告处理，并要求其在规定期限内改正。
• 后果说明：如果员工未在规定期限内改正，公司将采取进一步的措施，包括但不限于罚款、停职、解雇等。

四、跟进与监督

在发出书面警告后，您需要密切跟进员工的改正情况。如果员工在规定期限内办理了健康证并提交给了公司，那么问题就得到了解决。如果员工仍未采取行动，您则需要考虑采取进一步的措施，如按照公司规章制度进行罚款、停职或解雇等处理。

五、加强培训与宣传

为了避免类似情况再次发生，您应当加强员工对相关法律法规的培训和宣传。可以通过组织培训课程、发放宣传资料、在内部公告板上张贴相关法规等方式，提高员工对健康证重要性的认识。

六、法律途径（如必要）

如果员工持续拒绝办理健康证，且其行为已经对公司造成了严重的法律风险和业务影响，您可能需要考虑通过法律途径来解决问题。这包括向卫生行政部门举报、寻求法律援助或提起诉讼等。

总之，处理员工不办健康证的问题需要采取一系列正式且合规的措施。通过明确法规要求、与员工进行正式沟通、发出书面警告、跟进与监督、加强培训与宣传以及必要时采取法律途径等方式，您可以有效地纠正员工的行为，保障公司的合规运营和顾客的健康安全。