针对您提出的“公司起诉采购员吃回扣咋办”的问题，这是一个涉及商业贿赂违法行为的严肃议题，我将从法律、公司内部处理及后续防范措施三个方面为您详细解答。

一、法律层面

1. 行为性质认定： 采购员吃回扣的行为属于商业贿赂，这是明确的违法犯罪行为。它不仅违反了商业道德，更触犯了法律，可能构成贪污受贿罪或非国家工作人员受贿罪等。

2. 证据固定： 公司一旦发现采购员有吃回扣的嫌疑，应立即着手固定相关证据。这些证据包括但不限于采购合同、交易记录、回扣支付凭证、聊天记录、收条等。这些证据将作为后续法律程序中的关键依据。

3. 法律追责： 若查实采购员的行为构成犯罪，公司将有权向公安机关报案，由公安机关依法立案侦查，并追究涉事人员的刑事责任。根据情节轻重，涉事人员可能面临五年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金等刑事处罚。

二、公司内部处理

1. 内部制度执行： 公司应依据内部规章制度对涉事采购员进行纪律处分。这可能包括警告、罚款、解除劳动合同等。在严重情况下，如采购员的行为已构成犯罪，公司有权直接解除劳动合同，以起到警示作用。

2. 返还不当得利： 公司有权要求涉事采购员返还不当得利，即其通过吃回扣所获得的非法收益。这是公司维护自身权益的重要手段。

三、后续防范措施

1. 完善采购流程： 为防止类似情况再次发生，公司应完善采购流程，确保采购活动的透明度和公正性。这可能包括建立严格的供应商筛选机制、采购审批流程以及采购合同审查制度等。

2. 加强监督管理： 公司应加强对采购活动的监督管理，定期对采购人员进行培训和考核，提高其法律意识和职业道德水平。同时，建立内部举报机制，鼓励员工积极举报违法违规行为。

3. 民事诉讼索赔： 若公司因采购员受贿而遭受损失，公司还有权通过民事诉讼要求涉事采购员返还回扣并赔偿公司的损失。这是公司维护自身经济利益的重要途径。

总结：

面对采购员吃回扣的问题，公司应首先固定证据，明确行为性质；其次，依据内部规章制度对涉事采购员进行纪律处分，并要求其返还不当得利；最后，加强后续防范措施，完善采购流程，加强监督管理，以防止类似情况再次发生。同时，公司还有权通过民事诉讼要求涉事采购员赔偿损失。希望这些建议能对您有所帮助。