针对您提出的问题，即“母亲骑电动车肇当时没有监护人（但行为能力人的监护人设定在后），设监护人后需不需要赔偿”，我们可以从法律的角度进行详细分析。
首先，我们需要明确的是，无民事行为能力人或限制民事行为能力人造成他人损害的，原则上由其监护人承担侵权责任。这是基于《中华人民共和国民法典》第一千一百八十八条的规定，该条款明确指出：“无民事行为能力人、限制民事行为能力人造成他人损害的，由监护人承担侵权责任。监护人尽到监护职责的，可以减轻其侵权责任。”
现在，我们来具体分析您的情况：
肇事时监护人未设定：在母亲骑电动车肇事时，如果行为能力人（假设为未成年人或限制民事行为能力人）尚未设定监护人，这并不影响后续监护责任的承担。因为监护责任的设定是基于法律的规定，一旦符合条件（如未成年人达到法定年龄或限制民事行为能力人被认定为需要监护），监护人即应承担相应的责任。
监护人设定后：在监护人设定后，如果之前的行为能力人造成了他人损害，且该损害发生在监护人设定之前，但损害后果在监护人设定后显现或需要赔偿，监护人仍然需要承担赔偿责任。这是因为监护责任是基于行为能力人的行为而产生的，与监护人设定的时间无关。只要行为能力人在无监护或监护不当的情况下造成了他人损害，监护人就有义务进行赔偿。
赔偿责任的承担：在实际操作中，如果行为能力人有自己的财产，那么赔偿费用应首先从其财产中支付；不足部分，再由监护人赔偿。这是《民法典》第一千一百八十八条第二款的规定。
特殊情况：如果母亲作为电动车的驾驶人或实际操作控制人，在肇事过程中存在过错（如未拔出钥匙、未拉起手刹等），那么她也可能需要承担一定的责任。这取决于具体的事故情况和法院的判决。
综上所述，即使母亲骑电动车肇事时没有监护人，但在监护人设定后，如果行为能力人造成了他人损害，监护人仍然需要承担赔偿责任。这是基于法律的规定和监护责任的本质。因此，在面对此类情况时，监护人应积极履行赔偿义务，以保障受害者的合法权益。