工资和垫付货款能否一起申请仲裁，结论是通常不能一并处理，但垫付货款可通过劳动仲裁主张权利后再另行起诉，或直接以民事纠纷起诉。以下是对此问题的详细分析：

一、工资与垫付货款性质不同

工资是劳动者因提供劳动而应得的报酬，属于劳动争议的范畴，通常通过劳动仲裁解决。而垫付货款则是劳动者因工作需要为公司垫付的费用，其性质更接近于民事借贷或报销关系，不属于典型的劳动争议。

二、劳动仲裁的受理范围

根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动仲裁主要受理因确认劳动关系、订立、履行、变更、解除和终止劳动合同、除名、辞退和辞职、离职、工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训以及劳动保护等发生的争议。虽然垫付货款可能因工作关系而产生，但其本质并不属于上述列举的劳动争议范围。

三、实际操作中的处理方式

1. 分开处理：

   • 在实际操作中，劳动仲裁委通常会对工资请求进行仲裁，而对垫付货款请求不予处理，要求劳动者另行起诉。这是因为垫付货款争议更侧重于费用报销或民事借贷关系，需要法院进行更详细的审查和判断。

2. 证据收集与起诉：

   • 如果劳动者选择就垫付货款另行起诉，需要收集充分的证据来证明垫付事实的存在以及公司应承担的责任。这些证据可能包括公司年报、审计报告、转账凭证、报销单等。
   • 劳动者可以依据《中华人民共和国民法典》中关于借贷或合同的规定，向法院提起民事诉讼，要求公司偿还垫付的货款及逾期利息。

四、案例分析

以王某的案例为例，王某在为公司工作期间多次垫付费用，并在离职后向劳动仲裁委申请仲裁，要求公司支付工资和垫付的费用。然而，仲裁委仅支持了王某请求支付工资的请求，针对垫付的费用要求另案起诉解决。王某随后向法院另行起诉，并最终获得了法院的支持，判决公司偿还欠款本金及逾期利息。

五、建议与注意事项

1. 保留证据：劳动者在为公司垫付费用时，应尽可能保留相关证据，如转账凭证、报销单、公司确认函等，以便在需要时证明垫付事实的存在。
2. 及时主张权利：如果公司未按时偿还垫付的货款，劳动者应及时主张权利，避免超过诉讼时效。
3. 咨询专业律师：在处理此类纠纷时，劳动者可以咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及可能的法律后果。

如果有任何法律问题，特别是劳动纠纷、合同纠纷、房产纠纷方面的问题，都可以直接向我咨询。