可以申请劳动仲裁。针对您提出的“工资两个月算法不一样，是否可以仲裁”的问题，以下是从不同角度的详细分析：
一、法律背景与依据
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，劳动者与用人单位之间因劳动报酬、工作时间、休息休假、社会保险等发生的争议，均属于劳动争议的范畴，可以依法申请劳动仲裁。工资算法的差异，如果涉及到劳动报酬的计算方式、标准或支付时间等核心问题，且这种差异没有合理的解释或依据，那么很可能构成劳动争议。
二、可能的情况与法律分析
算法差异无合理依据：
- 如果两个月的工资算法存在显著差异，且用人单位无法提供合理的解释或依据（如政策调整、绩效考核变化等），那么这种差异可能被视为用人单位单方面变更劳动合同中的劳动报酬条款，违反了《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定。
- 在此情况下，劳动者有权要求用人单位按照原算法或合理的算法支付工资，并可以依法申请劳动仲裁，要求用人单位支付差额工资或赔偿损失。
算法差异有合理依据：
- 如果两个月的工资算法差异是由于合理的因素导致的，如政策调整、绩效考核标准变化、加班工资计算方式调整等，且用人单位能够提供充分的证据和合理的解释，那么这种差异可能不被视为劳动争议。
- 然而，即使存在合理依据，用人单位也应当提前告知劳动者算法的变化，并确保算法的变更符合法律法规和劳动合同的规定。如果用人单位未履行告知义务或算法变更违反法律法规，劳动者仍然可以依法维权。
三、法律建议与行动指南
收集证据：
- 劳动者应当收集与工资算法相关的证据，如工资条、银行流水、劳动合同、公司政策文件等，以证明工资算法的差异和用人单位的行为。
与用人单位协商：
- 在申请劳动仲裁前，劳动者可以尝试与用人单位进行协商，寻求解决方案。如果协商无果，再考虑申请劳动仲裁。
申请劳动仲裁：
- 如果劳动者认为工资算法的差异构成了劳动争议，且无法通过协商解决，那么可以依法向当地劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。在申请时，需要提交仲裁申请书、证据材料等。
寻求法律援助：
- 如果劳动者在申请劳动仲裁过程中遇到困难或需要法律帮助，可以寻求法律援助或咨询专业律师。
四、可能的法律后果
- 如果劳动仲裁委员会认定用人单位的行为违反了法律法规或劳动合同的规定，那么可能会裁决用人单位支付差额工资、赔偿损失或采取其他补救措施。
- 如果用人单位不履行劳动仲裁裁决，劳动者还可以依法向人民法院提起诉讼，要求强制执行裁决。
总结与建议：针对您的情况，如果两个月的工资算法存在显著差异且无合理依据，或者用人单位未履行告知义务或算法变更违反法律法规，那么您有权依法申请劳动仲裁。在申请前，请务必收集好相关证据，并尝试与用人单位进行协商。如果协商无果或需要法律帮助，请随时向我咨询。