结论：在政府部门工作人员办公期间拍摄他们的照片，是否侵犯其肖像权，需根据具体情况来判断，一般而言，若未经同意且用于营利目的或恶意丑化、贬损，则可能构成侵权；若仅为记录或监督等合理使用，则通常不构成侵权。
一、肖像权的法律定义与保护范围
肖像权，是指自然人以自己的肖像为表现形态，享有制作、使用、公开以及许可他人使用自己肖像的专有权利。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，任何组织或者个人不得以丑化、污损，或者利用信息技术手段伪造等方式侵害他人的肖像权。未经肖像权人同意，不得制作、使用、公开肖像权人的肖像，但是法律另有规定的除外。
二、拍摄政府部门工作人员照片是否构成侵权的判断标准
是否经过同意：
- 若拍摄前已获得被拍摄者的明确同意，则通常不构成侵权。
- 若未经同意，则需进一步考虑拍摄目的和使用方式。
拍摄目的和使用方式：
- 营利目的：若将拍摄的照片用于商业广告、产品宣传等营利活动，且未经被拍摄者同意，则构成侵权。
- 恶意丑化、贬损：若通过拍摄照片对被拍摄者进行恶意丑化、贬损，损害其名誉和形象，也构成侵权。
- 合理使用：若拍摄照片仅用于记录事件、监督政府行为等合理目的，且未对被拍摄者造成不良影响，通常不构成侵权。例如，新闻报道中拍摄政府工作人员办公场景，以反映政府工作状态或公开政府行为，一般属于合理使用范畴。
三、特殊情况下的考虑
公共场所拍摄：
- 在公共场所（如政府办公场所）拍摄，若拍摄行为本身不违反法律法规，且未对被拍摄者造成特别困扰或损害，通常不构成侵权。但需注意，即使是在公共场所，也应尊重他人的隐私权和肖像权，避免过度拍摄或不当使用。
政府工作人员的特殊身份：
- 政府工作人员在执行公务时，其形象和行为可能受到更多的公众关注和监督。但这并不意味着可以随意拍摄和使用其照片。仍需遵循肖像权保护的基本原则，即未经同意不得擅自使用。
四、法律建议与风险提示
尊重他人肖像权：
- 在拍摄和使用他人照片时，应事先获得被拍摄者的同意，并明确使用目的和范围。
合理使用与避免侵权：
- 若需拍摄政府工作人员照片用于非营利目的（如新闻报道、学术研究等），应确保拍摄行为合法合规，并避免对被拍摄者造成不良影响。
法律后果：
- 若未经同意擅自使用他人照片，可能面临被拍摄者的民事索赔要求，包括停止侵害、消除影响、赔礼道歉以及赔偿损失等。
总结：拍摄政府部门工作人员办公期间的照片是否侵犯其肖像权，需根据具体情况来判断。在大多数情况下，若拍摄行为合法合规且未对被拍摄者造成不良影响，则不构成侵权。但为避免潜在的法律风险，建议在使用他人照片前事先获得被拍摄者的同意。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。