劳动者因违反劳动纪律被停岗期间，用人单位一般需要支付其基本工资。以下是对此问题的详细分析：
一、法律法规依据
根据《工资支付暂行条例》第十二条的规定，非因劳动者原因造成单位停工、停产在一个工资支付周期内的，用人单位应按劳动合同规定的标准支付劳动者工资。虽然该条款直接针对的是单位停工、停产的情况，但其中的原则同样适用于劳动者因违反劳动纪律被停岗的情形，即在一个工资支付周期内，用人单位应支付劳动者工资。若超过一个工资支付周期，且劳动者没有提供正常劳动，则应按国家有关规定办理，但这并不意味着用人单位可以完全不支付工资，而是需要依据相关规定和劳动合同的约定来处理。
此外，原劳动部办公厅《关于处理案件若干政策性问题的复函》(劳办发[1994]322号)第2条也明确指出，企业对违纪职工用停工、停职的方式进行处理时，如有法律、法规依据，要严格按有关法律、法规办理；没有法律、法规依据的，不能采取停工、停职检查期间扣发工资和生活费的做法。
二、用人单位的自主管理权与限制
虽然用人单位享有一定的自主管理权，可以对违反劳动纪律的劳动者进行停岗等处分，但这种处分必须依法进行，不能违反法律法规的强制性规定。具体来说，用人单位在制定规章制度时，应确保规章制度的内容合法、合理，并已向劳动者公示。当劳动者违反规章制度时，用人单位可以依据规章制度进行处分，但处分措施应与劳动者的违纪行为相适应，且不得违反法律法规的强制性规定。
三、劳动者权益保障
劳动者在用人单位工作期间，享有获得劳动报酬的权利。即使因违反劳动纪律被停岗，劳动者也仍然享有这一基本权利。用人单位在停岗期间支付劳动者基本工资，是保障劳动者基本生活需要的体现，也是用人单位履行社会责任的表现。
四、特殊情况下的处理
如果劳动者因严重违反劳动纪律或法律法规而被解除劳动合同，那么用人单位将不再支付其工资。但这种情况与因违反劳动纪律被停岗而支付基本工资的情形是不同的。在停岗期间，除非劳动合同或规章制度中有特别约定，否则用人单位一般应支付劳动者基本工资。
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